Alexandra Naba is guest-editing a Topical Collection on “Methods for Extracellular Matrix Research in Development, Health, and Disease” for JoVE (formerly known as the Journal of Visual Experiments). This collection of papers aims to cover advanced experimental approaches in the field. she suggest that our group’s work would be an invaluable addition.

JoVE is the leading peer-reviewed scientific methods video journal whose goal is to increase method dissemination and reproducibility of research.

She would like to assemble a Topical Collection that will serve as the go-to resource for methods to study the ECM and their application across diverse fields of research and set standards for years to come.  The Collection will cover, but is not limited to:

• Techniques to profile the global composition of the ECM (g., proteomic, mass spectrometry imaging, multiplexed IHC)
• Techniques to image and quantify the physical and mechanical properties of the ECM from in-vitro cell culture systems or in-or ex-vivo samples across model organisms
• Methods to characterize the mechanisms of ECM assembly and remodeling
• Protocols to engineer in-vitro ECMs and ECM mimics with applications to cancer research, wound healing, or tissue regeneration
• Computational approaches to mine -omic datasets to gain insights into genetic, transcriptional, translational, and post-translational regulations of the matrisome across systems

If you are interested, submit an abstract at: https://app.jove.com/methods-collections/submit-an-abstract?collection_id=4883

or feel free to contact alexandra at: https://info.jove.com/mc_contact_editor?methods_collection_url=https://app.jove.com/methods-collections/4883/methods-for-extracellular-matrix-research-in-development-health-and-disease

Abstracts will be accepted until July 15, 2026, and full articles should be submitted by November 30, 2026.

Félicitations à Alexis DAVID et son directeur de thèse Fabien LECAILLE, de l’Université de TOURS (Inserm UMR 1100, Research Center for Respiratory Disease, RCRD), ainsi que leurs différents collaborateurs, pour leur récent article publié dans « Polysaccharides ».

La Cathepsin S (Cat S) est une protéase à cystéine impliquée dans différentes pathologies (auto-immunes, inflammatoire ou cardiovasculaires), cible intéressante pour le développement de traitements, et susceptible d’être inhibée par des glycosaminoglycanes de types Chondroïtines sulfates. Dans cet article, Alexis Fabien et leurs collaborateurs ont synthétisé et testé différents oligomères de CS et mis en évidence que des disaccharides de CS-4S ou leur dérivés multivalents ont des effets inhibiteurs sélectifs importants sur la cathepsine S, ouvrant ainsi la voie à de nouvelles stratégies thérapeutiques d’inhibition de cette enzyme.

https://doi.org/10.3390/polysaccharides6040099

Félicitations à Alexis David, doctorant dans l’équipe de Fabien Lecaille, de l’Université de Tours (Inserm UMR 1100) , et à leurs collaborateurs, pour leur dernier article publié dans  » Carbohydrate Poymeres  » et mettant en évidence que des exopolysaccharides d’origine marine sont des composés prometteurs pour préserver l’intégrité de l’élastine lors de processus inflammatoires, en régulant l’activité de la cathepsines.

https://doi.org/10.1016/j.carbpol.2025.123968

Félicitations à Luce Perié dont les travaux menés sous la direction de Cédric Picot au sein du groupe MEC-uP (Laboratoire ERRMECe, CY Cergy Paris Université) viennent d’être publiés en Open Access dans « Experimental Cell Research » (https://doi.org/10.1016/j.yexcr.2024.114251).

Ces travaux explorent le rôle de la Fibronectine, un élément clé de la matrice extracellulaire dans les processus du vieillissement cellulaire.

Les résultats de cette étude, menée à partir de biopsies de peau humaine provenant de donneurs de différents âges, montrent que la quantité de fibronectine diminue dans le derme réticulaire avec l’âge, tout en restant stable dans le derme papillaire. En parallèle, l’étude in vitro révèle que, bien que l’expression génique de la fibronectine augmente dans les fibroblastes sénescents, sa sécrétion et la formation de fibrilles diminuent, entraînant ainsi une désorganisation de la matrice extracellulaire (MEC). Cette altération pourrait être associée à l’expression de différentes isoformes de fibronectine détectées dans le sécrétome des cellules sénescentes.

Fait intéressant, l’invalidation de la fibronectine retarde l’entrée en sénescence des fibroblastes, tandis que leur culture sur un support enrichi en fibronectine accélère ce processus. Ces découvertes mettent en lumière le rôle crucial de la fibronectine dans le vieillissement cutané et ouvrent de nouvelles perspectives pour des stratégies thérapeutiques ciblant les maladies liées à l’âge.

Bravo a Laura Kuczynski-Noyau, Sixtine Karmann et leurs co-auteurs pour leur dernière publication dans « Nature Communications » », sous la direction de Virginie Mattot de l’équipe « Développement et plasticité du cerveau neuroendocrine » de l’Université de Lille (UME S1172). https://www.nature.com/articles/s41467-024-50798-9

Cette étude révèle l’importance de la matrice extracellulaire et en particulier du protéoglycane aggrecan dans la communication périphérie/cerveau qui est essentielle pour la régulation de l’homéostasie énergétique. En effet, un dépôt d’aggrecan est observé à une interface sang/cerveau déterminante pour le contrôle de la prise alimentaire et celui-ci restreint l’entrée des signaux métaboliques circulants au niveau du cerveau. Ce dépôt d’aggrecan est remodelé en fonction du statut nutritionnel puisqu’il s’étend lors d’une période de jeune réprimant davantage la diffusion des signaux circulants dans cette région cérébrale. La déstabilisation du réseau d’aggrecan conduit à une diffusion massive des molécules circulantes dans le cerveau et à une régulation anormale de la prise alimentaire chez la souris. La matrice extracellulaire au niveau de l’hypothalamus apparait donc comme un nouvel acteur dans la régulation centrale de l’homéostasie énergétique.

Bravo à Carine Laurent-Issartel dont les travaux menés sous la co-direction de Sabrina Kellouche et Franck Carreiras, de l’équipe ERRMECe, (EA1391) de l’Université de Cergy Pontoise, viennent d’être publiés dans la revue « Experimental Cell Research ».

Ces travaux portent sur l’ascite, qui constitue un microenvironnement unique, affectant l’intégrité du mésothélium et favorisant l’implantation intégrine-dépendante et la dispersion de sphéroïdes tumoraux ovariens au niveau du mésothélium. La composition en fibrinogène/fibrine de l’ascite favorise la création d’une niche pré-métastatique pour les métastases du cancer de l’ovaire et la formation de tumeur maligne secondaire. Comprendre l’impact du fibrogène/ fibrine ascitique en tant que cible moléculaire adhésive matricielle et potentiellement diagnostique dans la dissémination tumorale est essentiel. https://doi.org/10.1016/j.yexcr.2024.114155

Bravo à Adèle Mauroux dont les travaux menés sous la codirection de Florence Ruggiero et Laurent Muller, en collaboration avec la société Silab, viennent d’être publiés dans la revue Acta Biomaterialia (https://authors.elsevier.com/a/1jhLM6CFjZU1qv – PMID:39182802). Cette étude caractérise la vascularisation et la réparation en réponse à une blessure dans un modèle de peau reconstruite vascularisée, élaborée sans utilisation de biomatériau exogène. L’approche de feuillets cellulaires employée dans cette étude permet à des cocultures de fibroblastes, de kératinocytes et de cellules endothéliales de produire une matrice extracellulaire qui reproduit la complexité de composition et de structure du tissu d’origine. Ce modèle permet donc de moduler la densité vasculaire et le recrutement périvasculaire, ainsi que de suivre l’angiogenèse associée à la réparation tissulaire.

Ces travaux font suite à une première publication d’Adèle Mauroux qui mettait en évidence la génération in vitro de microenvironnements matriciels spécifiques aux sous-types de fibroblastes cutanés utilisés (Papillary and reticular fibroblasts generate distinct microenvironments that differentially impact angiogenesis – Acta Biomaterialia. 2023;168:210-222 – PMID: 37406716).

Bravo à Sandrine Vadon-Le Goff, Catherine Moali et leurs collaborateurs pour leur travail sur PCPE2 publié dans Nature Communication : nature.com/articles/s41467-023-43401-0.

En effet, elles mettent en évidence pour la 1ere fois chez l’homme que l’inhibiteur endogène des  protéases BMP-1/Tolloid-like (BTPs) humaines est PCPE-2. Ces BTPs sont indispensables au développement embryonnaire, à la croissance et à la réparation des tissus. Elles sont aussi impliquées dans de nombreuses pathologies telles que les fibroses et le cancer. Ces nombreux rôles nécessitent une régulation extrêmement précise, dont les acteurs avaient jusqu’à présent été identifiés dans d’autres espèces comme le poisson zèbre ou le poulet. Leur travail met en évidence pour la 1ere fois le role de PCPE-2 comme inhibiteur endogène spécifique de ces BTPs chez les mammifères, ouvrant ainsi la voie à de nouvelles stratégies thérapeutiques.

un article est également disponible sur CNRS-Biologie : https://www.insb.cnrs.fr/fr/cnrsinfo/morphogenese-et-cicatrisation-la-fin-du-mystere-de-la-regulation-des-proteases-bmp

Bravo à l’équipe de Florence Ruggiero et ses collaborateur pour laleur derniere publication dans PNAS qui a fait l’objet d’une actualité dans la Newsletter de l’INSB CNRS. En utilisant le poisson zèbre, ils démontrent que le collagène XV et la Tenascin C agissent de concert, telles les balises rouges et vertes à l’entrée d’un port, pour guider le trajet des axones des neurones moteurs de la moelle épinière,  qui doivent se frayer un chemin vers les cellules musculaires au cours du développement. Bioimprimé, ce duo protéique s’avère fonctionnel, ouvrant des perspectives prometteuses pour la régénération de nerfs endommagés.

https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2314588121

https://www.insb.cnrs.fr/fr/cnrsinfo/laxone-suit-un-chemin-balise-pour-rejoindre-sa-cible-musculaire.

Bravo à l’équipe d’Eva Faurobert (Institute for Advanced Biosciences IAB, CNRS Grenoble) et ses collaborateurs, pour leur article à paraitre. Force-mediated recruitment and reprogramming of healthy endothelial cells drive vascular lesion growth | bioRxiv. sur leurs travaux que nous avons eu le plaisir d’entendre lors du congres de la SFBMEC.

Félicitations à l’équipe de Carine Le Goff (INSERM U1148, Laboratory of Vascular Translational Science, Bichat Hospital, Paris, Université Paris Cité) et ses collaborateurs pour leur dernière publication dans Human Molecular Genetics !

Laure Delhon, Zakaria Mougin, Jérémie Jonquet, Angélique Bibimbou, Johanne Dubail, Cynthia Bou-Chaaya, Nicolas Goudin, Wilfried Le Goff, Catherine Boileau, Valérie Cormier-Daire, Carine Le Goff, The critical role of the TB5 domain of fibrillin-1 in endochondral ossification, Human Molecular Genetics, Volume 31, Issue 22, 15 November 2022, Pages 3777–3788, https://doi.org/10.1093/hmg/ddac131

Mutations in the fibrillin-1 (FBN1) gene are responsible for the autosomal dominant form of geleophysic dysplasia (GD), which is characterized by short stature and extremities, thick skin and cardiovascular disease. All known FBN1 mutations in patients with GD are localized within the region encoding the transforming growth factor-β binding protein-like 5 (TB5) domain of this protein. Herein, we generated a knock-in mouse model, Fbn1^Y1698C by introducing the p.Tyr1696Cys mutation from a patient with GD into the TB5 domain of murine Fbn1 to elucidate the specific role of this domain in endochondral ossification. We found that both Fbn1^Y1698C/+ and Fbn1^{Y1698C/Y1698C} mice exhibited a reduced stature reminiscent of the human GD phenotype. The Fbn1 point mutation introduced in these mice affected the growth plate formation owing to abnormal chondrocyte differentiation such that mutant chondrocytes failed to establish a dense microfibrillar network composed of FBN1. This original Fbn1 mutant mouse model offers new insight into the pathogenic events underlying GD. Our findings suggest that the etiology of GD involves the dysregulation of the extracellular matrix composed of an abnormal FBN1 microfibril network impacting the differentiation of the chondrocytes.

Bravo et merci à Charlie Colin Pierre et ses collaborateurs de l’équipe de Stéphane Brezillon (Université de Reims Champagne-Ardenne, Laboratoire MEDyC, CNRS UMR 7369) pour cette revue très complète en open access dans « Regenerative Medicine ».  Colin-Pierre C, El Baraka O, Danoux L, Bardey V, André V, Ramont L, Brézillon S. NPJ Regen Med. 2022 Dec 28;7(1):77. https://doi.org/10.1038/s41536-022-00267-y PMID: 36577752.

Heparan sulfate proteoglycans (HSPGs) are part of proteoglycan family. They are composed of heparan sulfate (HS)-type glycosaminoglycan (GAG) chains covalently linked to a core protein. By interacting with growth factors and/or receptors, they regulate numerous pathways including Wnt, hedgehog (Hh), bone morphogenic protein (BMP) and fibroblast growth factor (FGF) pathways. They act as inhibitor or activator of these pathways to modulate embryonic and adult stem cell fate during organ morphogenesis, regeneration and homeostasis. This review summarizes the knowledge on HSPG structure and classification and explores several signaling pathways regulated by HSPGs in stem cell fate. A specific focus on hair follicle stem cell fate and the possibility to target HSPGs in order to tackle hair loss are discussed in more dermatological and cosmeceutical perspectives.

Félicitations à l’équipe de Stéphane Brezillon et ses collaborateurs pour leur nouvelle publication dans « Am J Physiol Cell Physiol. » sur le rôle des SLRP et de leurs chaines de GAG dans la régulation de l’activité de MMP-14 !

Rivet R, Rao RM, Nizet P, Belloy N, Huber L, Dauchez M, Ramont L, Baud S, Brézillon S. Am J Physiol Cell Physiol. 2022 Dec 19. doi: 10.1152/ajpcell.00429.2022. Online ahead of print.PMID: 36534501

Small leucine-rich proteoglycans (SLRPs) are major regulators of extracellular matrix assembly and cell signaling. Lumican, a member of the SLRPs family, and its derived peptides possess anti-tumor activity by interacting directly with the catalytic domain of MMP-14 leading to the inhibition of its activity. The aim of this report was to characterize by in silico 3D modeling the structure and the dynamics of four SLRPs including their core protein and their specific polysaccharide chains to assess their capacity to bind to MMP-14 and to regulate its activity. Molecular docking experiments were performed to identify the specific amino acids of MMP-14 interacting with each of the four SLRPs. The inhibition of each SLRP (100nM) on MMP-14 activity and the constants of inhibition (Ki) were evaluated. The impact of the number of glycan chains, structures and dynamics of lumican on the interaction with MMP-14 was assessed by molecular dynamics simulations. Molecular docking analysis showed that all SLRPs bind to MMP-14 through their concave face, but in different regions of the catalytic domain of MMP-14. Each SLRPs inhibited significantly the MMP-14 activity. Finally, molecular dynamics showed the role of glycan chains in interaction with MMP-14 and shielding effect of SLRPs. Altogether, the results demonstrated that each SLRP exhibited inhibition of MMP-14 activity. However, the differential targeting of MMP-14 by the SLRPs was shown to be related not only to the core protein conformation but also to the glycan chain structures and dynamics.

Profs Dimitrios Zevgolis and Nikos Karamanos are putting together a Special Issue entitled ‘Extracellular matrix: The driving force of everything’ in Biomaterials and Biosystems (Elsevier). All papers will be peer-reviewed. Waived publication charges for 2022.

For more informations : Biomaterials and Biosystems | Journal | ScienceDirect.com by Elsevier

And contacts : dimitrios.zevgolis@ucd.ie; n.k.karamanos@upatras.gr; Emma.XU@elsevier.com

Zeinab Rekad est doctorante à l’Université de Nice Côte d’Azur. Elle réalise sa thèse dans le laboratoire d’Ellen Van Obberghen-Schilling à l’Institut de Biologie Valrose. Passionnée par la biologie des ARNs et la matrice extracellulaire, elle s’intéresse aux mécanismes de régulation des interactions entre les cellules et leur matrice extracellulaire et plus spécifiquement au rôle de la protéine liant les ARNs « SAM68 » dans l’adhésion des cellules endothéliales.

Dans cet article de revue, elle décrit avec ses co-auteurs, comment les différentes formes de « splicing » alternatif des gènes codant pour le matrisome impactent les propriétés structurales et fonctionnelles de la matrice extracellulaire et sont à l’origine de sa diversité, mais aussi en quoi des altérations de ces isoformes impactent plus largement l’homéostasie tissulaire et les processus oncogéniques.

https://doi.org/10.1016/j.matbio.2022.05.003

Highlights

•Environmental factors regulate spatial and temporal splicing of matrisome genes throughout life.

•Alternative splicing of matrisome genes drives structural and functional diversification of the ECM.

•Misregulation of ECM splicing isoforms impacts tissue homeostasis and oncogenic processes.

•We describe 4 easy ways to follow bioinformatics approaches to identify ECM gene splicing in cancer.