Ingénieur – Bio-informatique et génétique bactérienne – Lyon

Un contrat d’ingénieur en bioinformatique d’une durée de 24 mois est disponible au sein du Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI, Lyon), dans l’équipe « Pathogénie des staphylocoques », dirigée par le Pr François Vandenesch.

La personne recrutée sera en charge de :

  • Mettre en place les outils de bio-informatique nécessaires à l’analyse des données NGS : WGS, RNAseq et Tnseq
  • Conduire les analyses de données
  • Diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques ou de présentations orales
  • Gérer le stockage et la sauvegarde des données
  • Mise en place d’une base de données
  • Favoriser l’interface entre les partenaires biologistes et bio-informaticiens du projet
  • Organiser la veille scientifique et technologique

La personne recrutée travaillera en étroite collaboration avec les autres ingénieurs bioinformaticiens de l’équipe et du service BIBS (Bio-Informatique et Bio-Statistiques) du CIRI,
ainsi qu’avec les chercheurs de l’équipe.
Compétences recherchées:

  • Trés bonnes compétences et expériences dans le domaine de l’analyse des données de séquençage haut débit en général.
  • Très bonne maîtrise des langages de programmation couramment utilisés (Python, Perl, R, C/C++)
  • Maîtrise de l’environnement Unix/Linux
  • Maîtrise de l’anglais scientifique et technique
  • Autonomie, savoir travailler en équipe, sens de l’initiative et de l’observation, capacité d’interagir avec des personnes ayant différentes compétences (biologie, biostatistique, médecins, etc).

Durée du contrat : 24 mois
Recrutement : premier semestre 2017
Contact : Envoyer CV, Lettre de motivations et nom de 2 référents à Karen Moreau (karen.moreau@univ-lyon1.fr) et François Vandenesch (francois.vandenesch@univlyon1.fr)

 

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