Archives de catégorie : Recrutement

Offre de thèse : Étude des mécanismes d’assemblage du site actif de l’hydrogénase à [FeFe]

Une offre de thèse (CFR-CEA) est ouverte dans l’équipe Métalloprotéines de l’institut de Biologie Structurale à Grenoble (, pour travailler sur l’étude structural des mécanismes d’assemblage du site actif de l’hydrogénase à [FeFe].

Pour plus d’informations cliquez ICI

A doctoral position is available in the Metalloproteins Unit (MU) at the Institut de Biologie Structurale (IBS) in Grenoble – France ( group/) to work on the structural study of the the [FeFe]-hydrogenase active site assembly machinery.

For more information click HERE

BMS Oxford fellowship in Matrix Biology

BMS Oxford Research Fellow
NDORMS, Kennedy Institute of Rheumatology, Roosevelt Drive, Headington, Oxford OX3 7FY
Grade 7: £32,817 – £40,322 p.a.

More information: BMS fellowship in Matrix Biology

CDD ingénieur de 18 mois à l’IBS, Grenoble

Le groupe SAGAG recrute un ingénieur de recherche, titulaire d’un doctorat, et possédant une bonne expérience en biochimie des protéines et des oligosaccharides pour étudier les enzymes de biosynthèse des héparanes sulfates.

Pour en savoir plus et postuler, rendez-vous sur le site :

ATER ENS de Lyon: poste à pourvoir au 1er septembre 2021

Un poste d’attaché temporaire d’enseignement et de recherche (ATER) est ouvert au département de biologie de l’ENS de Lyon pour la campagne d’emploi 2021. Il s’agit d’un poste pour un an éventuellement renouvelable une fois, avec 192hTD de service d’enseignement.

Les profils d’enseignement et de recherche associés sont très ouverts: le/la candidat.e est appelé.e à rejoindre un des laboratoires de biologie de l’ENS de Lyon (CIRI, IGFL, LBMC, RDP) pour participer aux travaux de recherche de l’une de leurs équipes. Le/la candidat.e devra impérativement prendre contact avec le département d’enseignement d’une part et le laboratoire/l’équipe d’accueil qu’il souhaite rejoindre et proposer un projet de recherche établi en concertation avec l’équipe d’accueil.

Profil et instructions de candidature sur le site internet de l’ENS de Lyon:

Attention : date limite de candidature le 16 février 16h.

Full time post-doctoral position at the Centre Scientifique de Monaco

We are seeking a highly motivated postdoctoral fellow in coral cell biology to join the Coral Physiology team at CSM and participate in projects related to the biology of calcifying cells in tropical corals. Our goal is to look at coral calcification at the cellular level and more specifically 1) investigate the biology of  primary cilia in different tropical coral species and under different experimental conditions and 2) investigate the processes of endo/exocytosis in the model tropical coral Stylophora pistillata. Ultimately, we aim at understanding how these cellular processes are linked to the physiology of calcification in tropical corals.

Candidate profile:

  • PhD degree in  cell Biology or cell Physiology,
  • Experience in electron and confocal microscopy techniques,
  • Good knowledge of molecular and bioinformatics approaches,
  • Scientific background on primary cilia and/or exo/endocytosis processes and/or related aspects of cell biology/cell physiology,
  • A background in studying calcifying organisms is an advantage,
  • Ability and willingness to conduct laboratory work,
  • Excellent written and oral communication skills in English,
  • Ability to write publications for peer-reviewed scientific journals,
  • Ability to work independently and self-guided, but likewise within an interdisciplinary research team.

Initial appointment (ca. 2800 euros net + health insurance and pension) is for 12-months, with possibility of extension for a second year (subject to funding and performance). It will ideally start in March/April 2021. The position is supervised by Dr. Sylvie Tambutté (team leader), in collaboration with all team members.

Submission Documents:
Interested individuals are invited to submit an application package including :

  • a motivation letter explaining reasons for applying and how they meet the hiring criteria outlined above,
  • a research project of 1 to 2 pages including the description of the costs associated to the proposal (excluding the salary),
  • a CV,
  • a copy of PhD certificate,
  • name and address of at least two referees.

These application documents must be submitted as a single pdf to:
Sylvie Tambutté
Application Deadline: 28th February.
Note: application review will begin immediately.
The position will remain open until the position is filled.
Further information about the research focus of the Physiology team can be obtained at

Call for a chair position on Bioengineering and Tissue Engineering with a focus on bio- and 3D printing

Applications are open to specific fields. This call concern a position on Bioengineering and Tissue Engineering with a focus on bio- and 3D printing (Health Sciences and technologies department and College of Science and Technology). Please find more information in the document section.
This scheme aims to facilitate the recruitment of young lecturer-researchers on the basis of job profiles pre-identified by the institution in emerging and highly multidisciplinary disciplines or where there are strong international stakes. The scheme is part of a talent management policy shared with partner institutions, particularly research organizations. 
In this pre-recruitment chair system, the successful candidate will first be recruited on a fixed-term contract as a lecturer-researcher, during which his/her work will be monitored and evaluated according to the criteria defined during recruitment. The success of the evaluation could lead to a statutory lecturer-researcher position via the standard recruitment procedure (competitive procedure).
Candidates for the Chair are also encouraged to apply for other French and international funding that can be combined with the funding from the University of Bordeaux (ERC, ATIP-Avenir, ANR JCJC, etc….).
The chair will be funded for a period between three and five years maximum
The funding will cover the salary of the project leader for a maximum of 5 years.
Project-related costs (running costs, equipment and/or for the recruitment of staff dedicated to the project) may complete the Chair’s budget, within the framework of this program or within the framework of external funding (regional chair, Atip Avenir). Project related costs could be up to 200,000 euros on average for 5 years.


Closing date : 2021/02/22 at 12:00

More information :

Research Professor position: research on burn care at the CHUM Research Center Faculty of Medicine, Université de Montréal

Le Centre de recherche du Centre hospitalier de l’Université de Montréal (CRCHUM) en lien avec la Faculté de médecine de l’Université de Montréal et le Centre d’expertise des victimes de brûlures graves de l’ouest du Québec désire recruter un professeur chercheur adjoint ou agrégé dans le domaine de la recherche sur les soins aux grands brûlés. Le ou la candidat(e) doit détenir les compétences et l’expérience des approches en recherche fondamentale sur les soins aux grands brûlés.

La description du poste est disponible aux liens suivants :
En français :
En anglais :

12 Early Stage Researcher Positions in the Marie Skłodowska-Curie Innovative Training Network SkinTERM – Skin Tissue Engineering and Regenerative Medicine

We are recruiting 12 highly motivated and excellent early stage researchers (ESRs) for the Innovative Training Network “SkinTERM”, an EU Horizon 2020 Marie Skłodowska-Curie Actions funded project.

SkinTERM stands for Skin Tissue Engineering and Regenerative Medicine and aims to convert the normal mode of skin repair into skin regeneration by delivering excellently and multidisciplinary trained scientists able to take this research area to the next level. Today’s standard treatment of skin burns and large trauma is transplantation of autologous split-thickness skin. This carries a number of serious drawbacks, including pain, mobility-limiting contractures and disfiguring scars. SkinTERM aims to address wound healing in a completely different way, recapitulating regeneration rather than repair. Skin organogenesis will be induced by key elements taken from the extracellular matrix of foetal skin and the skin of species that exhibit no scarring in the regeneration process, and by employing (stem) cells from relevant cellular origins.

The project aims to create a new generation of entrepreneurial, multidisciplinary and intersectorially trained scientists with excellent career prospects in either academia, industry or government. Early stage researchers trained in this programme will be able to drive this research area further towards clinical translation in Europe.

More information on SkinTERM partners, individual ESR projects and application procedure can be found at


Please ensure that you fulfil the following eligibility criteria for ESR positions in H2020 MSCA-ITNs, as ineligible candidates cannot be considered:

  • The candidate must not have resided or carried out his/her main activity (e.g. work, studies, etc.) in the country of the host institution of interest (see individual project descriptions) for more than 12 months in the 3 years immediately before the recruitment date.
  • The candidate must hold a Master’s degree, be in the first four years of his/her research career and not have a doctoral degree.

Furthermore, the candidate is expected to develop into an independent researcher and is:

  • A team player able to work collaboratively in a multidisciplinary consortium.
  • Able to work independently and well-structured.
  • Proficient in written and spoken English.
  • Willing to move to the country of the host institution of interest and work for a prolonged. period abroad as part of the planned secondments (see individual project descriptions).


  • Enrolment in local PhD training programme
  • Extensive SkinTERM cross-sectorial training programme including soft skill development and specialist techniques
  • Contract of 36 months at one of the host institutions
  • Attractive salary including a living allowance, a mobility allowance and, if applicable, a family allowance as specified in the Horizon 2020 Marie Skłodowska-Curie actions Work Programme 2018-2020.

How to apply

Application deadline: Please send your application before December 21, 2020.

Application: Applications should be submitted via the APPLY link at the individual ESR position descriptions on You may apply for multiple ESR positions, but need to motivate for each position why you are interested in the particular position and what you can offer the project. Your application must include the following documents:

  • Motivation letter for the PhD position of interest
  • CV
  • Letters of recommendation (at least two)
  • Copies of diplomas, including grades

Note that ESR project 9  requires additional application for a Postgraduate Course at Durham University:

Note that ESR projects 10, 11 and 12 require additional application for the Life Science Zurich Graduate School of UZH:

Selection procedure: The first selection round will be an online interview with the representatives of the host institutions and of the secondments. The two best candidates will give a scientific presentation on a subject relevant for the ESR project. Candidates will be selected based on:

  • Outstanding academic ability
  • Requested skills and experience for the ESR project of interest
  • Motivation of the application for the ESR position of interest

Starting date: Successful applicants are expected to start on March 1, 2021.

Contact: For more information on the SkinTERM project and application procedure please contact Danique Hof MSc, project manager SkinTERM at

Recherche des candidats en vue de la création d’un poste de Professeur des Universités en Biologie Cellulaire à l’Université Claude Bernard Lyon 1

Le Laboratoire de Biologie Tissulaire et Ingénierie thérapeutique (LBTI, UMR 5305 CNRS et Université Lyon 1; recherche des candidats en vue de la création d’un poste de Professeur des Universités en Biologie Cellulaire à l’Université Claude Bernard Lyon 1 (section CNU 65). Le (la) candidat(e) devra avoir une solide expertise en Biologie Cellulaire, d’une manière générale, pour les enseignements en Licence, et particulièrement en Biologie Tissulaire, Interactions cellules-matrice extracellulaire, voire Mécanotransduction, pour des enseignements en Master. Le (la) candidat(e) renforcera l’axe « Réparation Tissulaire » de l’Unité et développera un projet en accord avec les thématiques développées par l’Unité, qui consiste à (1) comprendre les mécanismes fondamentaux de l’organisation d’un tissu, (2) comprendre et évaluer la capacité de réponse des tissus à différents types d’agressions extrinsèques et/ou intrinsèques et (3) proposer et tester des approches thérapeutiques innovantes dans le cadre de l’ingénierie tissulaire et de la médecine régénérative. Ainsi, une solide expertise dans l’étude des dialogues dynamiques cellule-cellule ou cellules-microenvironnements au cours des processus d’homéostasie et de réparation tissulaires est demandée.

Contact Recherche : Dominique SIGAUDO-ROUSSEL ( Contact Enseignement : Ulrich VALCOURT (

The Tissue Biology and Therapeutic Engineering Laboratory (LBTI, UMR 5305 CNRS and Université Lyon 1; ) is looking for candidates for a Full Professor position in Cell Biology at the University of Lyon (CNU section 65). The candidate should have a strong expertise (1) in general Cell Biology, for the teaching in Bachelor’s degree, and (2) in Tissue Biology, Cell-extracellular Matrix Interactions and/or in Mechanotransduction, to give lectures in the Master program. The candidate will strengthen the “Tissue repair” axis of the LBTI Unit research and will develop a research project in accordance with the topics that are developed in the research unit :(1) understanding the fundamental mechanisms of tissue organization, (2) understanding and assessing tissue response(s) to different extrinsic and intrinsic insults, and (3) proposing and testing innovative therapeutic approaches in the context of tissue engineering and regenerative medicine. A strong expertise in the study of dynamic cell-cell or cell-microenvironment cross-talks during homeostatis or tissue repair processes is required.

Research contact: Dominique SIGAUDO-ROUSSEL ( Teaching contact: Ulrich VALCOURT (


PhD student position in Tissue Repair & Wound Healing Biology

A 3-years PhD student position is available in the group of Patricia Rousselle in the Tissue Biology and Therapeutic Engineering Unit at the Institut de Biologie et Chimie des Protéines (IBCP), Lyon. The topics of research developed will focus on: i) Analysis of the biological properties of a 3D-skin equivalent model, ii) mechanisms involved in skin repair upon treatment with matrix biomimetic- scaffolds in animal models. The LBTI ( is well equipped for cell biology, molecular biology and biochemistry and belongs to a larger campus (SFR BioSciences Gerland – Lyon Sud (US8 / UMS3444,, giving access to state-of-the-art core facilities in areas ranging from animal models to protein science such as animal facilities, bioimaging, biomolecular analysis, proteomics, structural biology and production and analysis of proteins. Working languages of the laboratory are English and French.

We are looking for enthusiastic, self-motivated individuals with a background in tissue and cell biology and Imaging techniques. Know-how in cell culture and microscopic techniques is recommended. Excellent adaptability to team-work in different environments and mobility is absolutely required.

Starting date: January, 2021 or earlier (to be discussed).

Please send your CV, names of referees and a short informal description of yourself as a single PDF file to:
Dead line for applications: September 7, 2020.

PhD position : Targeting breast cancer metastasis – University of Liège (Belgium)

The Laboratory of Tumor and Developmental Biology, GIGA-Cancer, at the University of Liège (Belgium) has an opening for a PhD candidate on breast cancer resistance to targeted therapies (PI: Nor Eddine SOUNNI, team cancer and metabolism)

Topic: Targeting breast cancer metastasis

Project summary:

Despite advances in targeted therapies against HER2+, the presence of intrinsic and/or acquired resistance to anti-HER2 therapy remains an important challenge in breast cancer. In the triple negative breast cancer (TNBC), while it expresses high level of EGFR, anti-EGFR targeted therapies in combination with chemotherapies were generally unsatisfactory in clinical trials. This project is based on our recent paper (Foidart et al. 2019, Clinical Cancer Research) in which we demonstrated the clinical relevance of 3 molecules, EGFR, MT4-MMP and RB in TNBC and showed efficacy of targeting EGFR and CDK4/6 in 50% of TNBC expressing MT4-MMP, EGFR and RB. The new project aim is to understand mechanism(s) of MT4-MMP in breast cancer progression. We will investigate the repertoire of substrates of MT4-MMP by iTRAQ and MS analysis. We will validate the role of the target substrate and perform functional assays for evaluating their role in breast cancer proliferation and migration in vitro, and tumor growth and metastasis in vivo. Our ultimate goal is to propose new therapies for the untreatable TNBC and for therapy resistant HER2+ breast cancer.

Technically, the project involves cell culture, siRNAs, proliferation and migration assays, western blots and immunoprecipitations, and in vivo study using xenografts and PDX for tumor growth and metastasis.

The ideal candidate will be highly motivated and have a Master in Biomedical Sciences/Biology/Biochemistry.

The available funding is 4 years Télévie grant (F.R.S-FNRS) starting on October 1st 2019.

Interested candidates should send their résumé and application letter to Dr. Nor Eddine SOUNNI (

PhD student position in immunology, skin biology and extracellular matrix Department of Dermatology, University of Freiburg

We are looking for a highly motivated PhD student interested in immunology and the extracellular matrix to join our dynamic and international team at the Department of Dermatology, Medical Center – University of Freiburg, Germany. The project will focus on delineating the role of the lymphoid extracellular matrix in maintenance of systemic and skin immune homeostasis. Genetic skin blistering diseases will be used as models. For the studies, analyses of patient-derived samples, ex vivo and in vivo models will be employed. Practical knowledge of cell culture, basic immunological and biochemical analyses is needed; FELASA B certification or equivalent is an advantage. The position is fully funded for four years and part of a collaborative research center on immunology.

To apply, please send motivation letter with CV and contact information of three references to PD. Dr. Dimitra Kiritsi and Dr. Alexander Nyström

We are looking forward to your application!

Application deadline: August 1st.
Starting date: September 1st
Funded by: DFG, German Research Foundation
Duration: 4 years

Contact: Dr. Alexander Nyström PD. Dr. Dimitra Kiritsi


Nyström A et al.,. 2018. Impaired lymphoid extracellular matrix impedes antibacterial immunity in epidermolysis bullosa..Proc Natl Acad Sci U S A.

Kühl T et al.,. 2016. Collagen VII Half-Life at the Dermal-Epidermal Junction Zone: Implications for Mechanisms and Therapy of Genodermatoses. J Invest Dermatol.

Föll MC et al., 2018. Identification of tissue damage, extracellular matrix remodeling and bacterial challenge as common mechanisms associated with high-risk cutaneous squamous cell carcinomas..Matrix Biol

Spörrer M et al.,. 2019. Treatment of keratinocytes with 4-phenylbutyrate in epidermolysis bullosa: Lessons for therapies in keratin disorders. EBioMedicine.

Offre de thèse sur les ostéocytes à Bordeaux

Rôle des ostéocytes dans la régénération osseuse assistée par les biomatériaux.

Voici une offre de thèse sur les ostéocytes à l’université de Bordeaux dans l’équipe Interfaces tissu hôte / produits d’ingénierie tissulaire de l’unité de recherche Bioingénierie tissulaire.
Attention, les candidats souhaitant postuler doivent s’inscrire au concours de l’école doctorale avant fin mai et être bien classés.
Pour tout renseignement, contacter Delphine Maurel :

Post-doctoral position : 3D Electrostimulable polymeric scaffolds for drug screening-applications

A two-year postdoctoral position is opening at the Institute of Materials (iMat) of the University Paris-Seine (Cergy-Pontoise). The project includes two labs of iMat: LPPI (Polymer chemistry) and ERRMECe (Biology)

In vivo, cells are surrounded by the extracellular matrix (ECM), a 3D-meshwork of macromolecules. A great variety of dynamic biochemical, biophysical, topographical and electrical clues emanates from ECM. They govern cell survival, differentiation and others behaviors, and subsequently physiopathological processes. Especially, the microenvironment modulates cell phenotype and could subsequently orient cells’ response to drug agents and targeted therapies[1]. To take into account this native 3D-environment in cell-based assays, various supports have been developed. They are classified as scaffold-free (like spheroids) or scaffold-based supports (hydrogels, porous/fibrous scaffold) and are made respectively from natural ECM-derived molecules or synthetic material[2]. Among common synthetic commercial scaffolds, there are microfabricated scaffolds and the widely described electrospun fiber mats. Poly(High Internal Phase Emulsion) (polyHIPEs) presenting interconnected porous structures, have been described also as really promising 3D templates [3,4] but are, up to now, only available at laboratory scale.

Despite their advantages in terms of robustness, reproducibility and tunability in comparison to natural ECM-derived materials, these synthetic scaffolds rarely incorporate ECM molecules, thus losing the “biochemical component” of cell microenvironment. Moreover, such scaffolds display limited and uncontrolled dynamic and often lack the combined regulatory inputs as porosity, elasticity, topography, or electrical clues from the ECM that all contribute to modulating cell survival and functions[5]. In this context, the emergence of electroactive materials is of critical interest to mimic the environment of demanding cells regarding mechanical, morphological or electrical stimulation. Such materials represent a fast growing field and rely on the coatings of 3D porous structures with conducting materials. For instance, graphene coating on silk fibroin fiber mats, providing electrical conduction, improved the differentiation of PC-12 cells into neural phenotypes[6]. Coating with a conducting polymer (polyaniline) on similar scaffolds allowed electrical stimulation and enhanced differentiation of myogenic (muscle) C2C12 cells[7]. In addition to simple electrical conduction, conducting polymers (CPs), as electroactive polymers, can also provide additional functions rarely described in this field. Indeed, they are also able to change shape/volume and/or mechanical properties when electrochemically oxidized or reduced. Actually, when CPs are stimulated using low potentials (~ 1V), exchanges (insertion/expulsion) of counter-ions with surrounding electrolyte takes place, leading to electrochemically controllable volume changes[8] thus, allowing both electrical and mechanical stimulations.

LPPI has described the first rubbery electroactive electrospun scaffolds based on elastomer (Nitrile Butadiene Rubber) and polyethylene oxide (PEO) functionalized by a conducting polymer (poly(3,4- ethylenedioxythiophene) (PEDOT)[9,10]. Not evaluated yet as electroactive cell culture scaffolds, they presented promising actuation and beating functionalities in the presence of phosphate buffered saline (PBS). Preliminary data suggest their cytocompatibility. More recently conducting polymer coating has been used by Jager et al. to provide mechanical beating functionality to poly(lactic-co- glycolic acid) (PLGA) electrospun fibers and resulted in increased expression of cardiac markers of stem cells[11]. Nevertheless this unique example of mechanically active culture scaffolds displayed limited volume variations due to the high stiffness of PLGA fibers, highlighting the need of soft and rubbery 3D templates for efficient electroactive behavior. It is worth mentioning that polyHIPEs have never been functionalized by any electroactive material contrary to electrospun fiber mats.

In the frame of 3DEStim, we propose:

  • To develop 3D electroactive scaffolds for cell culture combining both electrical and mechanical stimulation. Such materials will be elaborated first from highly porous polyHIPE structures. A conducting polymer will be embedded into this matrix by oxidative chemical vapor phase polymerization of corresponding monomer.
  • To functionalize these scaffolds with adhesive ECM glycoproteins for displaying controlled properties and signal dynamic of in vivo cell environments. The cells responses to such ECM- containing scaffolds will be then studied.
  • To establish the proof of the concept of using such a device for drug response screening, firstly focusing on anticancer drug response, especially of ovarian cancer metastasis by tuning the scaffold to model their peritoneum implantation site, which displays in vivo dynamic resulting from breathing, digestion, and bodily movements.
    Thereafter, capitalizing on the acquired know-how, the 3D electoactive scaffold features as well as its ECM functionalization will be adapted to varied cell types in regard with the desired drug assays

Candidate Profile

  • PhD in Polymer Chemistry or biomaterials


  • Relevant research experience and demonstrated competencies in polymer and material
    synthesis. Experience in biomaterials and cell culture would be an asset
  • Track record of researcher dissemination including peer-reviewed publications
  • Ready to work according to best chemical or biology laboratory practices including lab safety.
  • Excellent project management, analytical, and report writing skills.
  • Excellent communication skills (oral, written, presentation).
  • Demonstrated ability to generate new ideas, concepts, models and solutions.
  • Collaborative skills, initiative, result oriented, organization, and capacity to work in an
    interdisciplinary environment.


  • French and/or English


  • less than 6 months in France since the last 3 years.


[1] Jebsen N. L. et al. Biomarker Panels and Contemporary Practice in Clinical Trials of Targeted Therapy. in Biomarkers of the Tumor Microenvironment. 2017
[2] Knight at al. J Anat. (2015), 227(6): 746–756.
[3] Moglia R.S. et al. Biomacromolecules (2014), 15, 2870−2878.
[4] McGann C.L. et al. Polymer (2017), 126, 408-418
[5] Kofron et al. J Physiol (2017), 595(12), 3891-3905.
[6] Aznar-Cervantes et al. Materials Science and Engineering: C (2017), 79, 315-325
[7] Zhang et al. Macromolecular Bioscience (2017) 17(9), 1700147
[8] Otero et al. J. Mater. Chem. B, 2016, 4, 2069–2085
[9] Kerr-Phillips et al. J. Mater. Chem. B, 2015,3, 4249-4258
[10] Kerr-Phillips et al. Biosensors and Bioelectronics, 2018, 100, 549-555, ISSN 0956-5663
[11] Gelmi et al. Adv. Healthcare Mater.2016, 5, 1471–1480

Offre de thèse au sein de l’équipe « Biocéramiques » de l’IRCER, UMR CNRS 7315 à l’Université de Limoges

Le sujet porte sur la « MISE EN PLACE D’UN MODÈLE BIOLOGIQUE DE CARACTÉRISATION _IN VITRO_ DES PROPRIÉTÉS ANGIOCONDUCTRICES ET ANGIOGÉNIQUES DE CÉRAMIQUES PHOSPHOCALCIQUES ». L’étudiant.e sera inscrit.e à l’École Doctorale n°609 Sciences et Ingénierie des Matériaux, Mécanique, Énergétique – SIMME de l’Université de Limoges.

Cette thèse sera effectuée au sein de l’équipe « Biocéramiques » de l’IRCER (Institut de Recherche sur les Céramiques [1]), UMR CNRS 7315 à l’Université de Limoges.

L’étudiant.e recherché.e sera titulaire d’un Master 2 Recherche, préférentiellement dans le domaine des Sciences de la Vie et plus particulièrement avec une spécialisation en biologie cellulaire et moléculaire. Il.Elle devra être sensibilisé.e au domaine des biomatériaux et devra être à même de travailler en équipe pluridisciplinaire.

Le candidat doit être autonome et doit avoir acquis une expérience en biologie cellulaire et moléculaire. Une bonne maîtrise des techniques de culture cellulaire et d’analyse du phénotype et des fonctions cellulaires est souhaitée.

Contacts (renseignements et candidature) : Amandine Magnaudeix et Eric
Champion ( ; )

PhD position in biochemistry : Design and investigation of adhesive proteins

Keywords: biomimicry, protein self-assembly, adhesion, surfaces.

  • Context and mission

In our daily lives, all conventional man-made adhesives are petrochemical products, which are toxic for the body and show limited efficiency in wet conditions, major drawbacks for biomaterials. In this project, we aim at producing adhesives effective in air and/or in wet conditions inspired by natural glues of some arthropods. This approach using simplified mimics of biological adhesives will facilitate better understanding of systems from which they are derived and could find applications in medicine as well as in biotechnology and industry.

Adhesive proteins of some arthropods have been identified. For these animals, the adhesion mechanism seems to be related to protein self-assembly on the surface. The molecular basis of this process has been elucidated by our team but its mechanisms remain to be elucidated. The goal of the PhD project is to produce adhesive proteins mimicking the natural one, to investigate the self-assembly process of these proteins and their adsorption/adhesion on materials. To achieve this goal, the project will involve a genetic engineering strategy, protein characterization approaches using biophysics and microscopies.

  • Candidate profile

We look for a highly motivated candidate with a strong knowledge in biochemistry, biophysics and/or in material science. The student should be able to work in a team, have very good writing skills (report, presentation…) and good knowledge of at least one of the language used in the lab: French, English.

  • The Laboratory and the team

The project will take place within “Equipe de Recherche sur les Relations Matrice Extracellulaire- Cellules” (ERRMECE: EA1391) from Cergy-Pontoise University (, in collaboration with the “Laboratoire des Matériaux et du Génie Physique”(LMGP: UMR 5628) in the Grenoble Institute of Technology (, known worldwide for its expertise in material science.

The ERRMECE lab is composed of 18 staff members and is organized in three research groups:

– BioSan: this team works on biomatrerials, especially on layer by layer films and interpenetrated network technologies;

– BCMI: this team works on microbial biofilms and anti-fouling strategies;

– MecUp: this team works on human extracellular matrix in physico-pathological contexts. Hence the lab has extensive expertise in the study of different extracellular matrices, on their composition and function, in relationships with cells and the functionalization of materials. The PhD project proposes new “matrix-like” models for the ERRMECe lab and will reinforce the axis on protein- material interactions by the collaboration with the LMGP.

  • Contact

Charlotte Vendrely, Uni. de Cergy-Pontoise, ERRMECe ;

The position is available for 3 years starting from: October 1, 2019.

Application dead-line is: May 17, 2019.

Université de Cergy-Pontoise, EA 1391,
Equipe de Recherche sur les Relations Matrice Extracellulaire-Cellules-ERRMECe
Groupe MEC-uP
Maison Internationale de la Recherche Rue Descartes
95031 Neuville sur Oise Cedex France

MCF section 66/68 à l’IUT de Lyon

La personne recrutée rejoindra l’équipe pédagogique de l’option Analyses Biologiques et Biochimiques (ABB) du Département de Génie Biologique de l’IUT Lyon1 et participera à la formation de techniciens supérieurs polyvalents à vocations multiples. Cette formation est proposée en deux ans ou sous la forme d’une « Année Spéciale » (ABBsp).

Plus spécifiquement, la personne recrutée assurera les enseignements de Travaux Dirigés et de Travaux Pratiques de Pharmacologie – Toxicologie de seconde année de DUT ABB (UE 3.2 et 4.2) et ABBsp (UE1.2 et 2.2), ce qui représente 160 heures eq TD. Son service sera complété par des enseignements de Travaux Pratiques de Physiologie Animale de première année (UE 2.2) et de filière ABB (UE 2.3)

La personne recrutée devra impérativement être titulaire d’une qualification à l’expérimentation animale pour concepteur de procédures et de projets (niveau 1/B) et avoir de l’expérience pratique en expérimentation animale. Elle devra participer à l’effort de réduction du recours à l’animal dans l’enseignement de la Physiologie et de la Pharmacologie en proposant des outils et méthodes alternatifs.

La personne recrutée contribuera également aux diverses activités du département de Génie Biologique, en participant par exemple à l’encadrement des stages, des Projets Tuteurés ainsi qu’aux différents jurys et soutenances. Enfin, à court terme, elle devra assurer la responsabilité pédagogique et administrative des formations réglementaires spécifiques à l’expérimentation animale pour concepteurs de procédures et de projets (niveau 1/B) et pour les personnels appliquant les procédures expérimentales que nous proposons au sein du département (niveau 2/A).

Contact : SAY Ludovic, Chef du département de Génie Biologique

Parmi les changements environnementaux actuels, les pollutions physico-chimiques environnementales constituent une problématique à forts enjeux scientifiques et sociétaux. Leurs effets se déclinent à différents niveaux d’organisation, depuis la cellule jusqu’au fonctionnement des écosystèmes. Le cœur du projet vise la caractérisation de l’exposome et le devenir des molécules polluantes au sein des organismes par des approches de toxicologie et pharmacologie expérimentales. Le/la candidate développera des applications sur les réponses adaptatives de la faune sauvage aux pollutions environnementales, en lien avec l’immunité, l’état de santé et les traits d’histoire de vie (en particulier la sénescence) des individus.

La personne recrutée rejoindra le Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (UMR 5558 LBBE) où il bénéficiera des suivis à long terme des populations (département Ecologie Evolutive) et de l’accès à un plateau expérimental pour des approches fonctionnelles, notamment sur animaux sauvages (animalerie Dubois). De plus, il/elle s’appuiera sur l’expertise et les travaux en cours dans les domaines de la pharmacologie (équipe Evaluation et Modélisation des Effets thérapeutiques) et de l’écotoxicologie (Modélisation et écotoxicologie prédictives).

Le programme de recherche du/de la candidat/e viendra renforcer la dynamique du laboratoire dans le domaine des conséquences de la pollution sur les organismes (projet Scientific Breakthrough UDL ALAN) et des interactions environnement/infectiologie (Labex Ecofect).

Contact : Manolo GOUY, Directeur du LBBE
+33 (0)4 72 43 11 67

Fiche de poste

Research engineer position EPFL (Ecole polytechnique fédérale de Lausanne)

Your mission
You will participate in the maintenance and daily operation of high-end electron microscopes and provide technical assistance and support to trained users.
Main duties and responsibilities include :

  • management of high-end transmission electron microscopes
  • maintenance and daily operation of microscopes
  • provide technical assistance to users
  • contribute to basic user training

Your profile

  • engineering school level education: haute-ecole superieur (HES) or equivalent
  • experience with high-tech lab equipment (vacuum systems, analytical instruments, clean room facilities or similar), experience in electron microscopy (not absolutely necessary)
  • solid knowledge of computer systems (Windows, Mac, network systems)
  • you like to ineract with clients/users
  • skills in French and English speaking and writing

We offer

  • excellent work conditions in a dynamic and interdisciplinary team
  • possibilities to extend your skills and horizon

Start date
1st of May (or at convenience)
Term of employment
Unlimited (CDI)
Work rate
Please send your application (cover letter, detailed resume and copies of certificates) by e-mail to :
More information

Post-doctoral position in Bioinformatics at CRCT-toulouse (France) – immune targeting of myeloma

A postdoctoral position, with salary funded for two years is available in the team 13 “Oncogenomic and immunology of myeloma” of the Cancer research Centre of Toulouse (team 13, CRCT) directed by Dr. Martinet and Pr Avet-Loiseau. The candidate will help defining the immune landscape associated with myeloma pathogenesis through bioinformatics analysis of large data sets generated through RNAseq, single cell RNAseq, ATAC seq and flow cytometry.

We seek a highly motivated scientist that hold a Ph.D with a strong background in RNA seq, single cell RNA seq, ATAC seq analysis and knowledge in immunology. Good track record, communication and organizational skills are expected.

The position is for 2 years, available immediately. The application should contain a motivation letter, CV and contact details of 2 referees.

The Host Institute
The newly created Cancer Research Centre of Toulouse (CRCT) gathers 250 scientists from 3 public research institutions (Inserm UMR1037, Université Paul Sabatier-Toulouse III and CNRS ERL5294) that have joined their efforts to launch innovative researches against cancer. The CRCT is equipped with the most recent technological tools and platforms including fully automated animal facility, flow cytometry platform, imaging platform and Next generation sequencing platform, 10X genomics platform (see

Toulouse is located in Southwestern France close to the Pyrenees Mountains and Spain with flight and train connections to French and European cities. With more than 100,000 students and praised quality of life, it is ranked as one of the best place to live and study in France.

Although myeloma development and outcome rely on genomic alterations, recent evidences highlight the influence of the immune microenvironment in the pathogenesis of this disease. In addition, given the promising clinical responses obtained by mAbs targeting immune pathways, interest in investigating immune functions in cancer is growing exponentially. Our team has already performed some innovative research in this area (JCI 2015, Cancer cell 2018, Blood 2018) and we now aim to use complementary set of experimental approaches involving both human samples and relevant mouse models to: 1. Identify immune parameters predicting myeloma relapse and outcome 2. Identify mediators driving myeloma associated immune defects. 3. Develop and test new immunotherapeutic strategies against MM. Our research team is highly connected with the routine Unit for Genomics in Myeloma (UGM) of the IUCT- oncopole that centralizes up to 2,500 samples per year from the different French medical centers through the IFM (Intergroupe Francophone du Myélome) network. All these annotated resources are stored for research purpose in our laboratory, with the opportunity to analyze immune parameters on large cohorts of homogeneously treated patients.

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Contact ludovic.martinet

Ingénieur en Techniques Biologiques (H/F), URCA, Reims

L’Université de Reims Champagne-Ardenne recrute un(e) Ingénieur en Techniques Biologiques qui exercera ses missions au sein de l’Unité Résistance Induite et Bioprotection des Plantes (RIBP-EA 4707) et du Laboratoire Signalisation et Récepteurs Matriciel (SiRMa, UMR MEDYC CNRS/URCA 7369) situés dans l’aile Biologie-Biochimie du bâtiment 18, campus Moulin de la Housse, UFR Sciences.
Le plateau technique est constitué de 2 appareils de PCR quantitative (CFX96 Biorad). Les postes de migration de gels d’électrophorèse et d’analyse (observation, sauvegarde des images) sont regroupés dans 2 pièces. Les postes d’extraction d’acides nucléiques et les appareils PCR « classiques » sont installés dans différentes pièces équipées au plus près des utilisateurs.

La personne recrutée assurera la responsabilité d’un plateau technique lié à l’activité de PCR quantitative et partagera son temps entre 2 laboratoires (50% chacun). Il/elle aura en charge les missions suivantes :

  • Surveiller les installations, assurer la maintenance de base, gérer les stocks de consommables et réactifs et assurer les négociations avec les fournisseurs
  • Effectuer le suivi et la mise à jour des stocks d’amorces, contrôler l’élimination des déchets selon les règles d’hygiène et de sécurités adaptées, gérer le planning d’utilisation
  • Former les utilisateurs aux techniques du domaine (de l’extraction des acides nucléiques à la mise en œuvre de la PCR quantitative) et participer au développement de nouveaux protocoles. Conseils aux chercheurs pour la mise en place des expériences
  • Assurer la veille scientifique et technique
  • Réaliser des prestations de service pour des laboratoires du site

Descriptif du profil recherché :

Il devra posséder les savoirs, savoir-être, savoir-faire suivants :

  • Maîtriser les techniques de biologie moléculaire du domaine
  • Maîtriser l’outil informatique d’enregistrement des données et de pilotage d’appareils
  • Sens du relationnel avec les interlocuteurs internes ou externes
  • Savoir rédiger des procédures techniques
  • Connaître les règles d’hygiène et de sécurité liées à la manipulation des produits toxiques et contaminants du domaine
  • Avoir des compétences en anglais (lu, écrit, parlé)

Contraintes particulières :
Disponibilité pour les personnes des 2 laboratoires
Manipulation avec certains produits hautement toxiques
Répartition éclatée des pièces de manipulation

Conditions :
Ouvert aux titulaires de la fonction publique par voie de détachement ou de mutation
Ouvert également aux non-titulaires dans le cadre d’un CDD jusqu’au 16/09/2019, éventuellement renouvelable
Poste de catégorie A (IGE)
Rémunération selon expérience
Ce poste est susceptible d’être aménagé pour les personnes en situation de handicap.

Date limite de dépôt de candidature : le 15/02/2019

Direction des Ressources Humaines
Bureau GPEEC

PhD and Master positions available in the College of Biomedical Engineering (CBME) at Taipei Medical University, Taiwan

The College of Biomedical Engineering (CBME) at Taipei Medical University, Taiwan, currently will soon have some vacancies and fellowships for Masters and PhD candidates. Below is a taste of the sorts of project that students might become involved with:

  • Biocompatible electronics for implantable brain-machine interfaces and sensors
  • Understanding how the brain responds to sports collisions, i.e. heading a football
  • New materials for use in dentistry, ligament repair, knee replacement and orthopaedics
  • Nanomedicines, such as nanoparticle eyedrops, inhalable liposomes for lung cancer therapy and stealth liposomes for brain targeting
  • Tissue engineering of skin, cartilage, heart and others
  • Platelet and other extracellular vesicles in tissue repair and diseases.

TMU partners with major teaching hospitals, so clinical collaborations/translational medicine approaches are highly encouraged. There are also opportunities to patent, publish and commercialise significant new findings.

We are able to provide fellowships and subsidised university accommodation for outstanding students, and normal tuition fees and living costs are still very reasonable for those who are not eligible for assistance.

Taiwan is a modern, convenient and safe place to live. Taipei has outstanding and affordable public transport, great local and international food, lots to see and do, and serves as a great hub for visiting the rest of Asia. There is a very active and passionate scientific research community, a keen collaborative spirit, and high professional standards.

Application period is January 1st – February 28, 2019

Information how to apply can be found at:

Alternatively, students may contact with any questions:

Responsable projet innovation biologie modèles 3D H/F – LVMH Perfumes & Cosmetics, Région d’Orléans, France

Responsable projet innovation biologie modèles 3D H/F

Company Name LVMH Perfumes & Cosmetics Company Location Région d’Orléans, France

Job description

Au sein de notre laboratoire d’efficacité in vitro composé d’une douzaine de personnes et rattaché au Responsable du laboratoire, vous avez en charge :

  • L’innovation technologique et la gestion de projets de recherche sur les modèles 3D de peau et les techniques d’imagerie cellulaire et tissulaire (mise au point de nouveaux modèles, mise en place de collaborations scientifique et technologiques)
  • Le pilotage des études in vitro liées aux technologies de biologie cellulaire, modèles 3D et imagerie : les demandes; la création du protocole avec le technicien ou l’ingénieur concerné ; la planification, le suivi, la communication des résultats et l’enregistrement des données pour le dossier d’information produit.
  • La veille scientifique, la rédaction de communications scientifiques en interne et en externe

A ce titre, vos principales missions consistent à :

  • Développer de nouvelles technologies permettant d’apporter des preuves de concept innovantes dans le domaine des modèles 3D et de l’imagerie
  • Réaliser des expertises permettant de prouver l’efficacité d’ingrédients actifs ou de formules sur des modèles de peau in vitro (modèles 3D ou explants)
  • Piloter avec la responsable du laboratoire les études in vitro liées au développement des produits de soins ou de maquillage faisant intervenir des technologies de biologie tissulaire et d’imagerie. Etre le garant des analyses et des rapports d’études rentrant dans le cadre du dossier d’information produit et fournir aux différents services clients (Claims, Open Innovation, Réglementaire, Marketing) les livrables attendus dans le respect des délais
  • Participer activement aux réunions et instances des processus R&I impliquant le laboratoire d’efficacité in vitro
  • Rédiger et présenter les résultats scientifiques dans des instances internes (réunions innovation, forums) ou externes (congrès internationaux, réunions fournisseurs…)

Profil :

  • Formation supérieure scientifique : Doctorat en Sciences
  • Expérience d’au moins 5 ans dans le développement de modèles de peau associée à une connaissance approfondie dans les techniques de microscopie et d’imagerie
  • Anglais courant
  • Capacité organisationnelle, rigueur
  • Esprit créatif, curiosité technique, ouverture d’esprit permettant de travailler dans un environnement innovant en faisant preuve d’agilité
  • Leadership
  • Bon relationnel

Poste à pourvoir à Saint-Jean de Braye (Loiret)

Contact : Emmanuelle Leblanc (

2 PhD positions in Lyon (France) and Freiburg (Germany)

2 PhD positions in Lyon (France) and Freiburg (Germany): Identification of extracellular matrix-derived therapeutic targets and biomarkers in dystrophic epidermolysis bullosa


  • Scientific context :

Dystrophic epidermolysis bullosa (DEB) is a rare skin blistering disorder caused by mutations in COL7A1 encoding the anchoring fibril protein collagen VII. The most severe forms are characterized by soft tissue fibrosis, which significantly contributes to disease morbidity and drives the major cause of death in severe DEB, that is cutaneous squamous cell carcinoma (cSCC). Some efforts to develop causal therapies have been successful but larger implementation is hampered by concerns surrounding efficacy, delivery, safety and costs. An alternative, which has shown preclinical success is to target changes occurring subsequent to skin fragility. The innovative nature of this proposal is to comprehensively analyze the main breeding ground of disease complications linked to fibrotic dermal ECM, to better understand how it is established and to derive much-needed biomarkers of disease progression. These studies will also pave the way towards the identification of novel relevant therapeutic targets, which could help to control aberrant skin remodeling and turn a severe disease into a milder disease.


  • PhD positions (36 months funded by DFG and ANR) :


  1. Department of Dermatology, Medical Center – University of Freiburg, Germany (PI : Dr. Alexander Nyström). Contact :

    The PhD student will perform experiments on primary cells (2D cultures, co-cultures, 3D organotypic skin co-cultures) and on mouse models, and employ histological, transcriptomic and biochemical analyses linked to these studies. He/she will be co-supervised by A. Nyström and D. Kiritsi (Group leaders, Medical Center – University of Freiburg).
  2. Tissue Biology and Therapeutic Engineering Laboratory (LBTI-UMR5305), CNRS-University of Lyon, France (PI : Dr. Catherine Moali). Contact : 

    The PhD student will be in charge of the analyses of skin cultures and biopsies using electron microscopy, immuno-detection and proteomics. Both shotgun and targeted (MRM) proteomic approaches will be used and one major objective will be to adapt specific protocols allowing the enrichment of extracellular matrix proteins in tissue samples. He/she will be co-supervised by C. Moali and P. Rousselle (Group leaders, LBTI).


Exchange programs between the two labs will be established.


  • Applications :

Applicants should submit their complete application file (CV, motivation letter and references) by email to one of the two labs before January 8, 2019.

Postdoctoral position – Naba Lab, University of Illinois at Chicago

The Naba Lab at the University of Illinois at Chicago is looking for an outstanding postdoctoral fellow. The successful candidate will join a young, dynamic and collaborative research team and lead a project employing a wide range of approaches (mouse genetics, cell biology, proteomics, and bioinformatics) to study the role of the extracellular matrix in cancer metastasis and developmental biology. Click here for more information.

Poste ATER – Biostatistiques/Biochimie – Univ. Paris Est

UFR de Sciences et Technologie – Laboratoire CRRET
Discipline : Biostatistiques/Biochimie
Discipline CNU ou 2nd degré : 67-64
Période : 1er octobre 2018 – 31 août 2019



Le laboratoire CRRET travaille sur des mécanismes de régulation de l’homéostasie tissulaire qui impliquent des interactions entre des héparanes sulfates (HS) et différentes familles de protéines régulatrices. Les enjeux actuels du CRRET sont de préciser les rôles de ces Glycosaminoglycannes (GAGs), et notamment des HS, dans des tissus riches en GAGs, comme le cerveau et le cartilage, au cours de processus fondamentaux de dégénérescence et de réparation, avec une forte composante inflammatoire en cas de pathologie. L’originalité de la recherche du CRRET, reconnue à l’échelle internationale, repose sur sa maitrise de la glycobiologie, ou biologie des glycosaminoglycanes (GAGs) et de leurs enzymes de biosynthèse, ainsi que sur sa maitrise de différents outils d’analyses rassemblés sur une plateforme de glycomique. Ces maitrises de technologies OMICS de pointe en biologie et en biochimie, qui permettent de collecter un grands nombre d’information afin d’identifier des biomarqueurs, nécessite également le développement de compétences en biostatistiques pour le traitement de ces « Big Datas ».

Adossés à ses compétences scientifiques, les chercheurs du CRRET sont responsables d’un parcours OMICS de la mention de Master STA2E de l’UPEC, qui permet depuis 2016 de former des étudiants aux nouvelles technologies OMICS (Génomique, transcriptomique, peptidomique, lipidomique, glycomique), du développement technologique des outils à la maitrise de l’analyse biostatistique des données obtenues, en passant par la gestion de plateformes. Ils sont également responsables des disciplines de Biochimie et de Biologie Cellulaire, qui comptent parmi les enseignements majeurs de la licence mention Sciences de la Vie et de la Terre et de ses différents parcours : Biologie Santé, Biologie Santé International, Biologie Environnement, Chimie-Biologie et Chimie-Biologie International, Biologie Géologie Enseignement.



Ce poste est associé à une charge d’enseignement de 192h (équivalent TD) partagée entre les Biostatistiques (section 67) pour 50% et la Biochimie (section 64) pour les 50% restants.

Les enseignements de Biostatistiques font partie des enseignements transversaux de tous les parcours de la licence mention SVT. Ils permettent aux étudiants d’acquérir les connaissances fondamentales nécessaires au traitement de données acquises par des protocoles expérimentaux biologiques. La personne recrutée participera à l’enseignement (TD et TP) de l’UE ‘Outils statistiques’ de L2, comprenant une partie « Probabilités » (variables aléatoires, lois de Probabilités) et une partie « Statistique » (tests d’hypothèse paramétriques et non paramétriques, analyse de variance et régression linéaire). L’application des principes et méthodes biostatistiques se fondera sur des exemples pris dans tous les aspects de la biologie, animale, végétale et microbienne. Ces enseignements de niveaux licence permettront aux étudiants d’aborder d’une façon plus efficace les Biostatistiques de niveau approfondi dispensées au niveau master. (Resp. Pr. Patricia ALBANESE ;

Les enseignements de Biochimie correspondent à une formation aux bases fondamentales des 4 principales familles de molécules biologiques (lipides, glucides, acides aminés / protéines et acides nucléiques) et aux principales réactions chimiques menant à ces molécules dans les organismes vivants. La personne recrutée participera aux enseignements (TD et TP) de niveau L1 au L3, en intervenant notamment dans les UEs de « Enzymologie » de L2 et L3, comprenant la mise en place protocoles expérimentaux nécessaires à l’étude des différents paramètres de variabilité des cinétiques enzymatiques et la compréhension des lois de vitesse. Il participera également aux enseignements pratiques et dirigés de l’UE de « Biochimie Structurale » de L1. (Resp. Pr. Dulce PAPY GARCIA ;



La personne recrutée participera à l’analyse biostatistique des données expérimentales et in-silico générées sur les plateformes du laboratoire, contribuant ainsi à la compréhension des processus cellulaires et biochimiques fondamentaux, comme l’inflammation, dans des tissus riches en GAGs comme le cerveau et le cartilage. Il/elle se focalisera sur les mécanismes d’action enzymatique des sulfotransferases sur les chaines de HS.

Le candidat devra avoir une forte expertise en biochimie (enzymologie) et biologie cellulaire (cultures primaires), des connaissances en expérimentation animale, en biologie moléculaire (production des lignées cellulaires KO ou transgéniques) et en biostatistique. Il/elle bénéficiera de l’expertise scientifique et technique des membres du laboratoire en matière de glycobiologie mais une expertise en neurobiologie ou en biologie du cartilage sera appréciée.

Nom du directeur du laboratoire : Professeur Dulce PAPY-GARCIA (


La fiche descriptive peut être téléchargée en cliquant ici.

Offre de these – Unité MEDyC « Matrice Extracellulaire et Dynamique Cellulaire » UMR CNRS/URCA 7369 – Reims, France

Unité MEDyC « Matrice Extracellulaire et Dynamique Cellulaire »

Intitulé du sujet
Mise au point d’une approche par split-ubiquitine pour l’identification des partenaires d’interaction de la neuraminidase-1 (NEU1) membranaire dans les macrophages et caractérisation fonctionnelle de nouvelles interactions.

Champs scientifiques
Biologie cellulaire, biologie moléculaire, biochimie, interactomique

Mots clés
Sialidase, partenaires d’interaction, monocytes/macrophages, peptides d’élastine, complexe récepteur de l’élastine, signalisation cellulaire, BRET.

Les sialidases (neuraminidases) constituent une famille d’exoglycosidases qui clivent les résidus d’acide sialique terminaux des glycoprotéines, glycolipides et oligosacharides. Leur présence affecte les propriétés moléculaires et structurales de ces glycoconjugués, modifiant ainsi leur fonction et leur interaction avec d’autres molécules à l’intérieur de la cellule, entre cellules, et entre les cellules et la matrice extracellulaire. Chez l’homme, la famille des sialidases comportent 4 membres dont la sialidase lysosomale NEU1. Des données récentes de la littérature montrent qu’en plus du lysosome, NEU1 peut être présente à la membrane plasmique de nombreux types cellulaires où elle est impliquée dans la transduction des signaux et dans l’élastogénèse au travers du complexe récepteur de l’élastine (CRE), et dans la régulation et la transactivation de nombreux récepteurs par désialylation. Par ailleurs, les travaux récents de notre équipe ont montré que cette sialidase jouait un rôle majeur dans les effets biologiques médiés par les peptides d’élastine, au travers du CRE, dans de nombreuses pathologies vasculaires telles que le diabète de type 2 (Blaise et al, 2013), l’athérosclérose (Gayral et al, 2014) et la thrombose artérielle (Kawecki et al, 2014). Par conséquent, NEU1 émerge comme un acteur clef de la régulation cellulaire.

En dépit d’un intérêt grandissant de la communauté scientifique pour NEU1, peu de choses sont connus sur le rôle de NEU1 dans les macrophages, acteurs critiques de l’athérosclérose. Cette pathologie vasculaire est à la base de nombreuses maladies cardiovasculaires (MCV) constituant la première cause de mortalité dans le monde et un problème majeur de santé publique. L’incidence des MCV augmente avec le vieillissement croissant de la population et génère des coûts directs et indirects colossaux en France, dans l’Union Européenne et dans la plupart des pays développés. Par conséquent, une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans l’athérosclérose est donc requise pour identifier de nouvelles molécules pharmacologiques innovantes, améliorer la qualité de vie de nos concitoyens et réduire les impacts financiers et sociétaux de ces pathologies vasculaires dévastatrices.

Ce projet de thèse de 3 ans qui s’inscrit dans le cadre d’un projet de recherche financé par l’ANR, se propose d’étudier et de décrypter le rôle de la NEU1 membranaire dans les macrophages en lien avec l’athérosclérose selon deux versants originaux. Le versant consacré pour cette thèse résidera dans la mise au point et le développement d’une approche par split-ubiquitine pour l’identification des partenaires d’interaction membranaires de la NEU1 dans les macrophages. Les résultats obtenus viendront compléter une première liste de candidats potentiels identifiés à l’aide d’une approche protéomique complémentaire. Par ailleurs, une partie importante de la thèse sera consacrée à la validation et la caractérisation fonctionnelle de nouvelles interactions par des techniques classiques de biologie moléculaire et cellulaire, de biochimie, mais également par approche par BRET (Bioluminescence Resonance Energy Transfer) en collaboration avec notre collaboratrice toulousaine. Par conséquent, une partie de la thèse (6 à 10 mois) sera réalisée à Toulouse, le reste se déroulant à Reims.

Les candidat(e)s intéressé(e)s sont invité(e)s à soumettre une lettre de motivation, un CV, une copie du relevé de notes et le nom de deux personnes référentes à :

Télécharger la fiche descriptive ici (English version available here).

Offre de thèse – Pr Hamid Morjani & Dr Emilie Buache – Université de Reims Champagne Ardenne


Pr Hamid MORJANI & Dr Emilie BUACHE / EA BioSpecT 7506 (BioSpectroscopie Translationnelle) / UFR pharmacie / Université de Reims Champagne Ardenne

Mots clés : Cancer du sein, Microenvironnement tumoral, Cancer associated adipocytes (CAA), Discoidin Domain Receptor (DDR), Spectroscopie vibrationnelle

Résumé :

Les avancées récentes en biologie des cancers ont fait émerger un rôle paracrine majeur du stroma dans la progression tumorale, notamment dans les phases d’invasion locale, un prérequis pour la formation des métastases. Ainsi, le concept proposé par Paget dès la fin du XIXème siècle de « la graine et du sol », associant à une cellule devenant incontrôlable un terrain propice à sa survie et à son expansion, reste tout à fait pertinent. Les données issues de l’étude du stroma permettent actuellement d’améliorer les critères pronostiques et diagnostiques dans certains cancers. Cependant, en termes de traitement, bien que des études précliniques aient montré le potentiel de développement d’outils thérapeutiques efficaces ciblant des facteurs du stroma, beaucoup reste à faire. Le défi actuel est de disséquer, au niveau moléculaire, la dynamique réciproque qui s’établit entre les cellules épithéliales cancéreuses et leur microenvironnement, dans le but de mettre en avant des cibles stromales potentiellement intéressantes.

Notre projet, situé à l’interface physique/biologie, s’inscrit parfaitement dans ce contexte. En effet, nous souhaitons caractériser les CAAs (ou adipocytes associés au cancer), présents au front d’invasion tumoral, véritables acteurs de la progression tumorale mammaire. Grâce à un modèle pertinent de co-culture entre adipocytes et cellules cancéreuses mammaires, nous proposons une étude double approche. D’une part, nous nous focaliserons sur la spectroscopie Raman, nous permettant d’accéder à l’imagerie cellulaire non invasive adipocytaire. D’autre part, une étude transcriptomique par stratégie Affymetrix sera menée en tandem.

In fine, cette approche vise à proposer, sur la base de signatures vibrationnelles spécifiques du statut des CAAs, de nouveaux biomarqueurs pronostiques et prédictifs de la réponse thérapeutique, dans le contexte du cancer du sein.

En parallèle, nous proposons d’engager des études fonctionnelles afin d’identifier de nouveaux mécanismes moléculaires associés au dialogue entre les adipocytes et les cellules tumorales. En particulier, l’incidence des CAAs sur le remodelage de la matrice extracellulaire sera examinée car ces modifications confèrent au microenvironnement tumoral des propriétés permissives à la dissémination métastatique. Dans cet objectif, un intérêt certain sera accordé au récepteur à domaine discoïdine DDR2 car ce dernier est requis pour la synthèse et la modulation de l’agencement des fibres de collagène par les fibroblastes activés. Au-delà des retombées en termes de connaissance scientifique, ces analyses devraient nous permettre de proposer de nouvelles stratégies thérapeutiques.

Contact :     

Offre de thèse à l’interface Biologie – Biophysique – UMR CNRS 7369 – Reims, FR

Thèse à l’interface Biologie – Biophysique

Développement d’Outils d’analyse du REmodelage Matriciel par Imagerie Haute Résolution (DOREMI).

Durée : 3 ans à compter du 1er octobre 2018

UMR CNRS 7369, Matrice Extracellulaire et Dynamique Cellulaire (MEDyC)
Équipe Modélisation Moléculaire et Imagerie Multi-échelle (MIME)
Université de Reims Champagne Ardenne, UFR Sciences Exactes et Naturelles
Moulin de la Housse, Bât. 18, 51687 Reims cedex 2

Directeur de thèse : Pr. Laurent Debelle
Co-encadrant : Dr. Sébastien Almagro



Les maladies cardiovasculaires et métaboliques sont les atteintes les plus observées au cours du vieillissement. Ces pathologies chroniques progressent lentement sans symptôme visible jusqu’à atteindre une situation critique où la maladie est définitivement installée. Lors de ce processus, la matrice extracellulaire vasculaire est dégradée. En particulier, les lames élastiques présentes au sein de la paroi vasculaire sont altérées et ne remplissent plus pleinement leurs rôles. Comme l’élastine qui les compose n’est plus produite au-delà de l’adolescence, toute altération survenant sur ces structures est fondamentalement irréversible et contribue au vieillissement vasculaire.

En collaboration avec nos collègues de l’Université de Manchester, notre laboratoire s’intéresse aux modifications survenant au sein des parois artérielles et à leur évolution, notamment dans le cadre de pathologies liées à l’âge comme le diabète ou l’insuffisance rénale chronique. Nous avons ainsi développé une technique d’imagerie par rayonnement synchrotron X (Diamond Light Source, Didcot, UK) sans agent de contraste qui permet d’obtenir des coupes optiques à très haute résolution (800 nm). Les images obtenues (définition : 2560x × 2560y x 2560z, 16 bits) sur des segments d’artère de souris de plusieurs mm de long permettent de reconstruire le volume artériel et révèlent, au sein des parois, des détails ultra­-structuraux jusque-là inconnus.

Nous avons développé un premier programme d’analyse d’image (script Matlab) qui permet d’isoler les structures élastiques contenues dans les parois artérielles en vue de les analyser qualitativement et quantitativement en 3D.


Travail de thèse

Le travail à réaliser dans le cadre de ce projet de thèse comporte deux grands axes ; une partie analyse d’image visant à développer et améliorer l’outil logiciel déjà présent ; une partie imagerie haute résolution qui sera réalisée en étroite collaboration avec nos collègues anglais.

A – Analyse d’image

Le principal objectif de ce projet sera d’améliorer le système d’analyse d’image afin de le rendre plus efficace dans la détection des structures et des modifications structurales des échantillons.

Il faudra ensuite rendre la détection du logiciel moins sensible aux variations de l’échantillon afin que la méthode d’analyse d’image puisse être généralisée afin de simplifier la démarche d’analyse. En effet, des échantillons à comparer peuvent donner lieu à des images ayant une luminosité ou un contraste différent. Le logiciel devra pouvoir s’affranchir de ces différences pour faciliter la comparaison des échantillons entre eux.

Le logiciel développé sera mis en œuvre sur les données d’imagerie haute résolution déjà disponible dans l’équipe, celles qui seront générées lors durant la thèse, mais aussi sur celles obtenues par nos collaborateurs (Angleterre, Espagne, Suisse).

B – Imagerie Synchrotron

Au cours de la thèse, l’étudiant-e sera amené-e à préparer des échantillons en vue de les imager par microtomographie X sur un synchrotron. Il lui appartiendra en particulier d’améliorer la méthode de préparation des échantillons (murins voire humains), afin d’obtenir des échantillons dans un contexte physiologique le plus proche possible des conditions in vivo et d’obtenir la meilleure qualité d’image possible sans utiliser d’agents de contraste.

Ce travail sera principalement réalisé à Reims mais l’étudiant-e recruté-e devra également se rendre en France ou à l’étranger pour acquérir des images sur synchrotron ou réaliser des expériences en lien avec le sujet proposé. Il pourra s’agir de séjours courts (moins d’une semaine) ou plus longs.


Profil recherché

Le-la doctorant-e, biologiste ou bio-informaticien(ne), devra impérativement avoir des connaissances en programmation informatique (exemple : langage orienté objet) et/ou traitement d’image/du signal. Idéalement, la personne aura de plus une première expérience de Matlab et d’ImageJ, mais des compétences en d’autres langages (Python, etc…) peuvent aussi convenir.

L’étudiant-e devra également être capable de préparer les échantillons d’origine animale. Idéalement, la personne aura une première expérience en expérimentation animale. La personne intègrera une équipe de biologistes, bio-informaticiens et biophysiciens d’une dizaine de personnes.


Contact : et

Tél : et

Les personnes intéressées par ce sujet sont invitées à envoyer les éléments suivants.

  • CV et lettre de motivation
  • Relevés de notes L, M1, M2 + attestation de réussite de Master si déjà disponible


Recrutement :

Le recrutement est organisé par l’Ecole Doctorale Sciences Fondamentales Santé de l’Université de Reims Champagne Ardenne.

Le recrutement aura lieu durant la première quinzaine de septembre, selon un calendrier qui n’est pas encore précisé.


Fiche de renseignement peut être téléchargée en cliquant ici.


Recrutement d’un(e) enseignant(e) contractuel(le) en Biochimie à temps-plein – UNIVERSITÉ SAVOIE MONT BLANC

UFR Science et Montagne

Recrutement d’un(e) enseignant(e) contractuel(le) en Biochimie à temps-plein.

L’Université Savoie Mont Blanc recrute un(e) enseignant(e) contractuel(le) dans les disciplines de Biochimie et Biologie moléculaire.

Missions pédagogiques

Ces enseignements de Biochimie et Biologie moléculaire seront assurés en Licence de Sciences de la Vie (L1 à L3) et prendront la forme de cours magistraux en amphithéâtre (100 à 130 heures), travaux dirigés par groupes de 40 étudiants (150 à 180 heures) et travaux pratiques et expérimentaux par groupes de 20 étudiants (150 à 180 heures). Des compétences en biologie cellulaire et génétique seront appréciées et pourront donner lieu à des activités pédagogiques dans ces champs disciplinaires. La personne recrutée pourra marginalement être amenée à intervenir en support en travaux pratiques de biologie cellulaire en L1.

Service d’enseignement

Le service de l’intéressé(e) s’effectuera au sein du Département de Sciences de la Vie de l’USMB et est calculé sur une base annuelle de 1 607 heures. La durée maximale du contrat est de trois années.
Ce service correspond à 384 heures d’enseignement « équivalent travaux dirigés » en présence des étudiants, a minima, avec un maximum de 960 heures (entre 384 et 960, les heures sont rémunérées en heures complémentaires).
Le solde pour parvenir à 1 607 heures correspond à des tâches liées aux heures d’enseignement (préparation des cours, surveillance des examens, correction des copies d’examens) ou à caractère péri-pédagogique (participation à la vie de l’équipe d’enseignement, réunions pédagogiques, suivi de stages, jurys, missions d’information sur l’orientation, etc.) ;

Profil et compétences recherchés

Le recrutement est ouvert à toute personne titulaire a minima d’un master (ou son équivalent) en biochimie. Une première expérience professionnelle en enseignement (dans le secondaire ou le supérieur) est fortement souhaitable.
La personne retenue fera preuve d’autonomie dans la gestion de ses enseignements, associée à des capacités au travail en équipe avec les collègues enseignant(e)s, personnels administratifs (scolarité) et techniques (laborantin(e)s).

Base salariale

L’indice de rémunération des enseignants contractuels est aligné sur l’indice de rémunération détenu à l’issue des trois premières années du grade des professeurs certifiés de classe normale (Indice Majoré 440, soit salaire mensuel brut de 2061.85 €).


Pédagogie :
Madame Christiane GALLET
Administratif :
Responsable Administrative UFR SceM
Téléphone :

Thèse en glycobiologie des GAGs, Nancy

Un sujet de thèse est proposé à l’école doctorale Biologie Santé-Environnement (BioSE) de l’Université de Lorraine, portant sur la recherche d’un nouveau biomarqueur prédictif et pronostique dans le cancer du sein HER2+: la 3-O-sulfotransférase 3A (3-OST3A).

Equipe d’accueil
UMR 7365 CNRS-Université de Lorraine, Ingénierie Moléculaire et Physiopathologie Articulaire (IMoPA)
Groupe MolCelTEG (Molecular and Cellular Therapeutic Engineering and Glycosyltransferases)
Biopôle de l’Université de Lorraine – Campus biologie-santé
Faculté de Médecine – 9, Avenue de la forêt de Haye – BP 50184 – 54505 Vandoeuvre-lès-Nancy Cedex

Pour plus d’informations, consultez la fiche de renseignements ici.

Master 2 dans le groupe SAGAG, IBS, Grenoble

Stage de Master 2 portant sur le projet de recherche intitulé : « enzymatic regulation of cell-surface glycanic landscape in human disease »

A Master 2 position is open within the SAGAG team in Grenoble for the academic year 2017-2018. Successful candidate will be entitled a GRAL scholarship of 8000 euros to follow Grenoble University Integrative Structural Biology (ISB) Master 2 program (which includes topics in Structural Biology, Biochemistry, Molecular and Cellular Biophysics), and a 6 month internship on the research project entitled: « biosynthetic and post-synthetic mechanisms regulating HS structure ».

The level of the candidate academic records will be a determinant factor of success for the application. Foreign candidates are encouraged to apply.

Application deadline : 13th of May 2018


Learn more about the research project…
Learn more about the GRAL scholarship and Grenoble University Integrative Structural Biology (ISB) Master 2 program

PhD proposition – MESR funding / start october 2018 – Toulouse, France

Structure/properties relationships of constitutive biopolymers of the oral mucosa: definition of molecular and organizational markers of ageing
Contact: /
Doctoral school ED SDM :
Profile : biomaterial science, Physico-chemistry
Candidature before April 20th

Key words: physical structure, thermal analysis, biomaterials, spectroscopies



Health sector is one of the 5 areas of research and development of the Chimie Balard Cirimat Carnot Institute. With an ageing population, the thematics Ageing and improvement of the quality of life is a primary challenge of the society, both at the national and european level. Edentulism is prevalent in ederly patients and the current treatment is the use of removable protheses based on edentulous jaw regions. Nevertheless, the close and extended contact of prosthetic intrados with fibromucosa and the transmission of occlusal strengths trough the prosthesis leads to a weakening of supporting tissues in the medium to long term. This embrittlement may be accompanied by pain, compromising the proper integration of prostheses. In geriatics, the peculiar weakness of bearing surfaces, connected to physio-pathological conditions as well as the decrease of adaptability and resistance further complicate the biomechanical integration of this kind of prosthesis.

It has been shown that chronical ageing induces a decrease of resiliency and hydration of oral mucosa, associated with a decrease of epithelium thickness; nevertheless few studies have been performed at the molecular and supramolecular level to characterize this mucosa, and even fewer on the structural and mechanical evolution with ageing. FTIR [1] and Raman [2] analyses on animal mucosa are promising techniques of characterization on such tissues, as well as dielectric analysis used to discriminate between safe and pathological mucosa [3].

Techniques of material characterization (Fourier transform Infrared spectroscopy, Differential scanning calorimetry (DSC), Thermostimlulated currents (TSC), Dynamic dielectric spectroscopy (DDS) and Dynamic mechanical analysis (DMA)) have been shown to be well suited to study different biological tissues and proteins in the PHYPOL team of CIRIMAT [4,5]. The objective of this work is to adapt these techniques to scan the physical structure and dynamics of mucosa in order to extract vibrational, thermal, mechanical and dielectric markers and to follow their evolution with ageing.

The complementarity of the thesis directors (materials physicist and hospital practioner) will be considered an advantage to manage this plurydisciplinary subject, based on biophysical characterization, where the clinical issues are promising.

Retro planning

October 2018-january 2019: earliest stage

  • Research and tests validations on porcine mucosa State of art /Design of clinical study

February 2019-February 2021:

  • Biophysical analyses (FTIR/Raman/TSC/DSC/DMA) of human mucosa Multivariate analysis of data
  • Extraction of ageing markers Communications (Congresses/publications)

February 2021-September 2021: Thesis report/communications


  1. J.C. Schwarz, E. Pagitsch, C. Valenta, Comparison of ATR–FTIR spectra of porcine vaginal and buccal mucosa with ear skin and penetration analysis of drug and vehicle components into pig ear, Eur. J. Pharm. Sci. 50 (2013) 595–600.

  2. A. Sahu, A. Deshmukh, A.D. Ghanate, S.P. Singh, P. Chaturvedi, C.M. Krishna, Raman Spectroscopy of Oral Buccal Mucosa: A Study on Age-Related Physiological Changes and Tobacco-Related Pathological Changes, Technol. Cancer Res. Treat. 11 (2012) 529–541.

  3. C. Murdoch, B.H. Brown, V. Hearnden, P.M. Speight, K. D ’apice, A.M. Hegarty, J.A. Tidy, J. Healey, P.E. Highfield,

    M.H. Thornhill, Use of electrical impedance spectroscopy to detect malignant and potentially malignant oral lesions, Int. J. Nanomedicine. 9 (2014) 4521–4532.

  4. Lacoste-Ferré, P. Demont, J. Dandurand, E. Dantras, D. Duran, C. Lacabanne C., Dynamic mechanical properties of oral mucosa: comparison with polymeric soft denture liners, Journal of the Biomechanical Behavior of Biomedical Materials, 2011, 4(3) 269-274.

  5. R. Tang, V. Samouillan, J. Dandurand, C. Lacabanne, M.-H. Lacoste-Ferre, P. Bogdanowicz, P. Bianchi, A. Villaret, F. Nadal-Wollbold, Identification of ageing biomarkers in human dermis biopsies by thermal analysis (DSC) combined with Fourier transform infrared spectroscopy (FTIR/ATR), Ski. Res. Technol. 23 (2017).


Offre de thèse (PhD position) EDISS – Lyon

Structure and interactions of the propeptide of lysyl oxidase

Disciplines: Biochemistry – Structural Biology
Laboratory: (ICBMS, UMR 5246, Dir: Olivier Piva, team Extracellular and Pericellular Supramolecular Assemblies, Head: Sylvie Ricard-Blum)
Doctoral school: Interdisciplinary Doctoral program in health-sciences (EDISS) – ED 205

Scientific background and rationale: Lysyl oxidase is an amine oxidase, which is secreted as a proenzyme and catalyzes the first step of collagen and elastin cross-linking in the extracellular matrix (ECM). Its proteolytic activation releases the N-terminal propeptide, which is involved in ECM assembly, acts as a tumor suppressor, inhibits cell signaling, and stimulates adipogenesis. The propeptide is intrinsically disordered and may fold upon binding to its partners. Preliminary interaction data have been obtained by the team for the propeptide.
Aim: The aims of the project is i) to identify extracellular and membrane partners of the propeptide in order to determine if it has further functions, ii) to study if and how it interferes with ECM enzymatic cross-linking, iii) to characterize the 3D structure of the complexes formed by the propeptide and its partners, and iv) to determine the impact of the R158Q mutation, which inhibits the pro-adipogenic and anti-tumoral activities of the propeptide, on the above processes.
Description of the project methodology: The propeptide and its potential partners will be expressed under a recombinant form in prokaryotic and eukaryotic cells. The interactions of the purified proteins will be identified and characterized (kinetics and affinity) by Bio-Layer Interferometry. Binding sites will be localized in vitro and/or in silico by molecular modeling. The structure of supramolecular complexes will be studied by small-angle X-ray scattering, small-angle neutron scattering and cryo-electron microscopy.
Expected results and perspectives: This project will allow to determine if the propeptide interacts via different molecular recognition processes to its different partners and to decipher the molecular mechanism(s) underlying its role in ECM assembly and cross-linking, adipogenesis and cell signaling. It will also give molecular insights on the effect of the R198Q mutation, which is associated with an increased risk of breast cancer.
Skills required: The applicants should have backgrounds in protein biochemistry, molecular biology, biophysics and structural biology.


  • Friesenhengst A, Pribitzer-Winner T, Schreiber M. Association of the G473A polymorphism and expression of lysyl oxidase with breast cancer risk and survival in European women: a hospital-based case-control study. PLoS One (2014) 9:e105579.
  • Griner JD, Rogers CJ, Zhu MJ, Du M. Lysyl oxidase propeptide promotes adipogenesis through inhibition of FGF-2 signaling. Adipocyte (2017) 6:12-19.
  • Trackman PC. Functional importance of lysyl oxidase family propeptide regions. J Cell Commun Signal (2018) 12:4 5-53.

Keywords: Extracellular matrix, Bioactive fragments, Intrinsic disorder, Biomolecular interactions, Interaction networks

Contact: Prof. Sylvie Ricard-Blum
Application should include: CV, application letter, Names and addresses of two references.
The application file should be sent before May 14, 2018 to
The open competitive recruitment process is in two steps: 1. Internal laboratory procedure. 2. Interdisciplinary jury of EDISS.

Offre de thèse (PhD position) EDISS – Lyon

Understanding the mechanisms of dysregulated collagen turnover in skin wound healing pathologies

Disciplines: Biochemistry, cell biology, proteomics
Laboratory: Group Metalloproteinases and Tissue Remodeling (C. Moali)
Tissue Biology and Therapeutic Engineering Laboratory (LBTI) directed by B. Verrier
Doctoral school: Interdisciplinary Doctoral program in health-sciences (EDISS) – ED 205


Scientific background and rationale: Skin wound healing is a complex and tightly regulated process which aims at restoring skin structural and mechanical integrity. This process can be defective in a number of pathological contexts linked to ageing, genetic or acquired diseases and lead to non-healing or fibrotic wounds1. Among the numerous pathways which contribute to wound healing pathologies, the imbalance between the synthesis and degradation of fibrillar collagens is known to play a crucial role.

Aim: The main objective of the PhD project is to analyze the molecular mechanisms controlling collagen assembly and degradation in normal and defective skin wound healing.

Description of the project methodology: Skin biopsies and skin cells originating from mouse models and patients material will be analyzed using a large variety of techniques (biochemistry, shotgun and targeted proteomics, imaging techniques, molecular biology, western blots). The rare genetic disease dystrophic epidermolysis bullosa (DEB) will be used as a model of defective skin wound healing involving clear signs of dysregulated collagen turnover2 in collaboration with A. Nyström (University of Freiburg, Germany). The first step will be to characterize the main features of the collagen network in normal and disease samples. Then, the expression and activity of the main proteins involved in the regulation of collagen assembly and degradation3,4 will be analyzed to identify potential targets for therapeutic intervention.

Expected results: The results from this study will provide important information on the mechanisms which are dysregulated in DEB and in the large number of diseases which also display alterations of collagen turnover.

Perspectives: The main perspectives are to identify new biomarkers of DEB progression and to design novel evidence-based therapeutic approaches of DEB which could also be extended to other skin wound healing pathologies.

Skills required: High motivation and interest for science; training in biochemistry or cell biology; knowledge of skin physiopathology, extracellular matrix and/or proteomic approaches would be an advantage; fluency in English is absolutely required.

1. Gurtner et al. Nature 453:314-21, 2008.
2. Nyström et al. EMBO Mol. Med. 7:1211-28, 2015.
3. Vadon-Le Goff et al. Matrix Biol. 2015, 44-46, 14-23.
4. Bekhouche et al. FASEB J. 2016, 30, 1741-56.
5. Delolme et al. Cell. Mol. Life Sci. 2015, 72, 1009-27.

Keywords: wound healing, skin, collagen, proteinases, fibrosis, epidermolysis bullosa

Contact (Supervisor Name and email): Catherine Moali
Application should include: CV, application letter, Names and addresses of two references.
The application file should be sent before May 1, 2018 to Catherine Moali.
The open competitive recruitment process is in two steps: 1. Internal laboratory procedure. 2. Interdisciplinary jury of EDISS.

PhD position ad available here.

Opportunity for Imaging Specialist at Nestle Research Centre

Dear all,

I am writing to you to let you know about an interesting opportunity we have here at the Nestlé Research Centre for a imaging specialist. We are looking for a dynamic young imaging specialist to become the functional lead of our small imaging team (3 persons). Ideally they would be experienced across a range of imaging techniques, both optical and electron microscopy, be a dynamic outcome oriented person with experience working across different projects and have preferably between 1 and 5 years experience post PhD. Experience with food like systems would be bonus. If you know of someone that you think would be interested in this position, could I ask that you forward the attached description to them and please encourage them to contact me or my colleague Vincent Meunier if they have any questions.

Warmest Regards,

PhD student position, Department of Dermatology, Medical Center – University of Freiburg

PhD student position, Department of Dermatology, Medical Center – University of Freiburg

 A PhD student position is available starting immediately at the Department of Dermatology, Medical Center – University of Freiburg. The focus of the studies will be on squamous cell carcinoma.  The project is part of a collaborative research center on cell migration, cancer invasion and metastasis (CRC/SFB850). Some basic knowledge of biochemistry is an advantage, passion for translational medicine a must.

To apply or for questions please contact Dr. Alexander Nyström, Group leader, Department of Dermatology, Medical Center – University of Freiburg.

We are looking forward to your application.

Project-related references:

  • Föll MC, Fahrner M, Gretzmeier C, Thoma K, Biniossek ML, Kiritsi D, Meiss F, Schilling O, Nyström A*, Kern JS. Identification of tissue damage, extracellular matrix remodeling and bacterial challenge as common mechanisms associated with high-risk cutaneous squamous cell carcinomas. Matrix Biol.2017.*Corresponding author.
  • Mittapalli VR, Madl J, Löffek S, Kiritsi D, Kern JS, Römer W, Nyström A, Bruckner-Tuderman L. 2016. Injury-driven Stiffening of the Dermis Expedites Skin Carcinoma Progression. Cancer Res. 76:1-12, 2016.
  • Kühl T, Mezger M, Hausser I, Handgretinger R, Bruckner-Tuderman L, Nyström A. High Local Concentrations of Intradermal MSCs Restore Skin Integrity and Facilitate Wound Healing in Dystrophic Epidermolysis Bullosa. Mol Ther 23:1368-79, 2015
  • Nyström A, Velati D, Mittapalli VR, Fritsch A, Kern JS, Bruckner-Tuderman L. Collagen VII plays a dual role in wound healing. J Clin Invest 123:3498-509, 2013.

Offre de thèse chimie des GAGs ICOA

Veuillez trouver ci-dessous un lien vers une offre de thèse en chimie des GAGs à l’ICOA. N’hésitez pas à diffuser dans vos laboratoire.

Romain Vivès
Structure & Activités des Glycosaminoglycanes (SAGAG)
Institut de Biologie Structurale

Postdoctorat en sciences biomédicales – NUI Galway (Irlande)


BOURSE DE POST-DOCTORAT : La National University Ireland, Galway recrute un post-doctorant pour deux ans, en sciences biomédicales, dans les domaines de la recherche et du développement d’appareils médicaux et qui inclut les domaines des glycosciences et l’ingénierie des protéines.

CONDITIONS : bourse ouverte aux citoyens l’Union Européenne, n’ayant pas résidé en Irlande pendant plus de 12 mois ces 3 dernières années.

A PROPOS DU PROGRAMME MEDTRAIN : MedTrain [1] est un programme cofinancé par l’Union Européenne. Il vise à développer le potentiel créatif, entrepreneurial et innovant des chercheurs grâce à une formation avancée et une mobilité internationale et intersectorielle.


Bien cordialement,

Louise Aupetit
Scientific Project Manager
01 277 5054
66 Fitzwilliam Lane, Dublin 2 [2]


Candidate for position in biomedical materials and tissue engineering

Dr Hulmes has received the following request from Dr Yang Liu, a lecturer from China. He is looking for a position (and has already some funding) but David is unable to welcome him. Please contact Dr Liu directly if you are interested (the contact details are in the CV attached to the post below). Thank you



Dear Prof. Hulmes, DJS,
I am writing to you about the possibility of studying and researching in your lab as a visiting scholar. My name is Yang Liu. I’ve got my Ph. D degree in South China University of Technology under the supervision of Professor Wang Yingjun (Academician of Chinese Academy of Engineering), majored in Materials Science. Now, I’m working at Changzhou University as a lecturer.
Your researches are of particular interest to me, especially in the field of biomedical materials and tissue engineering. Since you are a well known specialist in this field, I believe that it will be very helpful to my academic career if I have the chance to continue my research work under your advice. I believe my former education and research experiences, which match your research direction highly, have prepared me a well candidate for a further research with you and under your supervision. The Jiangsu Provincial Department of Education has approved my request to study abroad. They will provide me with 1600 dollars per month along with a round-trip ticket as financial support for one year.
If you are interested in my curriculum vitae, please unfold the attachment. Your favorable consideration of my application will be greatly appreciated. I am looking forward to hear from you.

Sincerely yours,
Yang Liu

CV available here

Four Tenure Track Positions in the profiling theme Fibrosis Diseasome – University of Oulu

The University of Oulu invites outstanding candidates to apply for four (4) Tenure Track Positions in the profiling theme Fibrosis Diseasome – Fibrosis as a shared risk factor in the etiology of complex chronic diseases and unhealthy ageing.

The online job application is here and you can see a detailed description of the profile in this document.

offres de thèse financée et de stage – Institut Langevin

Offres de thèse financée et de stage autour de la microscopie a super-resolution en molecule unique a l’Institut Langevin:

  • Offre the thèse / postdoc : Single-Molecule Fluorescence Lifetime Imaging Nanoscopy – Fiche descriptive
  • Offre de stage : Dual-objective super-resolution microscopy to study DNA repair mechanisms – Fiche descriptive


Postdoctoral positions – Cleveland Clinic – Cleveland, OH

Please see the document attached here for more information about the availability of several postdoctoral fellowships in the laboratory of Dr. Suneel Apte to investigate the proteomics and biology of cardiovascular development and disease. These positions will suit recent PhDs, MD/PhDs, or MDs with a career interest in proteases, extracellular matrix, proteomics, mouse genetics, cardiovascular disease, and systems biology.

Download the flyer here.