10 postes (CDI) de bioinformaticiens/biostatisticiens (H/F) à l’Institut Pasteur (Paris)

 

La direction de l’Institut Pasteur a défini la bioinformatique et la biologie des systèmes comme priorités stratégiques. Un « Centre de bioinformatique, biostatistique et biologie intégrative » (C3BI – https://c3bi.pasteur.fr/) a vu le jour en 2015 sur le campus parisien. L’objectif de ce centre est de fédérer/renforcer les activités bioinformatiques et biostatistiques dans les divers domaines de recherche de l’institut, autour de la biologie de la santé.

Dans ce contexte et après vingt-huit recrutements depuis 2014, l’Institut Pasteur prévoit à nouveau de recruter en CDI dix bioinformaticien(ne)s/ biostatisticien(ne)s en 2017. Affiliée au C3BI et au Hub de bioinformatique et biostatistique, et supervisée par le directeur du C3BI, chaque personne recrutée sera affectée pour une part de son temps dans les unités de recherche et/ou les plates-formes technologiques. Des missions d’enseignement (académique et/ou formation permanente, possiblement à l’international) pourront aussi être confiées aux personnes recrutées.

 

MISSIONS ET RESPONSABILITES

La mission principale est d’apporter un soutien aux unités de recherche et plates-formes pour l’analyse bioinformatique et/ou statistique de leurs données. Ce soutien prendra plusieurs formes :

  • conseiller et guider dans l’utilisation de méthodes et outils d’analyses existants,
  • maintenir une veille bibliographique active et évaluer les outils et méthodes publiés,
  • développer lorsque nécessaire des méthodes et outils d’analyse nouveaux,
  • analyser des données en collaboration avec les unités et plateformes,
  • participer à l’élaboration et la mise en œuvre de projets collaboratifs de type ANR ou ERC,
  • assurer le transfert d’outils et de compétences vers les unités et plateformes,
  • assurer des formations en bioinformatique et biostatistiques,
  • pérenniser et assurer le maintien des méthodes et des outils développés par les unités, et assurer leur intégration dans les solutions centrales (Galaxy,…),
  • participer activement à la mise en place du portail web de la plateforme de bioinformatique de l’Institut Pasteur, largement ouverte à la communauté internationale,
  • interagir avec le Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP, 33 instituts dans le monde entier), en particulier pour la mise en place de formations et l’analyse de données.

 

PROFILS DE POSTE

Les recrutements 2017 se feront prioritairement dans les profils suivants :

  • analyse d’images biologiques
  • nouvelles technologies de séquençage haut débit (single cell, long reads)
  • épigénétique – épigénomique
  • génomique humaine – génétique statistique
  • annotation des génomes et protéomes eukaryotes
  • évolution, phylogénie, génétique des populations
  • métagénomique
  • biologie des systèmes et modélisation
  • développement de logiciels et pipelines bioinformatiques
  • data management

 

PROFILS DES CANDIDATS ET CONDITIONS

Pour postuler il est nécessaire de justifier un des deux profils suivants:

  • niveau bac+5 (master, ingénieur ou équivalent) en bioinformatique, statistiques, mathématiques appliquées ou un domaine apparenté, suivi d’une expérience professionnelle d’au moins 3 ans dans la recherche ou le soutien à la recherche en bioinformatique, biostatistique ou analyse de données biologiques,
  • doctorat en bioinformatique, statistiques, mathématiques appliquées ou un domaine apparenté, suivi d’au moins 2 années d’expérience professionnelle après la thèse dans la recherche ou le soutien à la recherche en bioinformatique, biostatistique ou analyse de données biologiques.
  • Une bonne expérience en enseignement en bioinformatique/biostatistiques sera un plus, ainsi qu’une expérience de l’international, notamment dans les pays en voie de développement.

 

POUR CANDIDATER

Les candidatures (motivations, CV détaillé et références) sont à déposer en ligne via l’URL suivante.
La date de clôture des candidatures est fixée au 5 septembre 2017. La présélection des candidat(e)s aura lieu aux alentours du 3 octobre 2017. Les candidat(e)s retenu(e)s seront convoqué(e)s pour un entretien entre le 10 et le 12 octobre 2017 (dates à réserver impérativement).

 


10 Permanent Positions in Bioinformatics and Biostatistics at Institut Pasteur (Paris)

 

Bioinformatics, biostatistics and integrative biology have emerged as strategic priorities for the Institut Pasteur. A new “Center for Bioinformatics, Biostatistics and Integrative Biology” (C3BI – https://c3bi.pasteur.fr) has been created in 2015 on the Parisian campus. The objective of this center is to federate and strengthen capacities in bioinformatics and biostatistics in the different research areas developed within the institute around biology and health.

Within this framework and after 28 recruitments since 2014, Institut Pasteur proposes again ten permanent positions in bioinformatics and biostatistics for 2017. Successful applicants will be affiliated to the C3BI and to the Hub of Bioinformatics and Biostatistics and will be supervised by the director of the Center. They may be assigned for most of their time to other research units and/or technological platforms within Pasteur. Additionally, the positions also foresee teaching activities both at Paris and in the Institut Pasteur International Network.

 

TASKS AND RESPONSIBILITIES

The main objective is to provide support to research units and platforms at Institut Pasteur for the analysis of their data using bioinformatics and statistics approaches. This support will be provided in various ways:

  • advising and guiding in the use of existing methods and tools
  • maintaining an active bibliographical survey and evaluating existing tools and methods
  • developing new methods and tools when needed
  • collaborating with research units and platforms to analyze their data
  • helping, defining and implementing collaborative projects such as ANR, ERC, etc.
  • transferring knowledge and tools towards research units and platforms, and providing training in bioinformatics and biostatistics
  • supporting and maintaining methods and tools developed by research units, and ensuring their integration within open platforms such as Galaxy, …
  • actively participating in the implementation of the web portal of the Pasteur Institute bioinformatics platform, to be open to the international community,
  • interacting with the Institut Pasteur International Network (IPIN, 33 institutes all around the world), mainly for setting up trainings and analyzing data

 

AVAILABLE POSITIONS

This year positions will mostly focus on the following domains:

  • Biological image analysis
  • Statistical genetics – Human genomics
  • New HTS data (single cell, long reads …)
  • Epigenomics
  • Annotation of eukaryotic genomes and proteomes
  • Evolution, phylogeny, population genetics
  • Development of software and bioinformatics pipelines
  • Metagenomics
  • Systems biology and modeling
  • Data management

 

EXPECTED PROFILES

In order to apply, you need to:

  • hold an engineering or master degree in (bio)informatics, (bio)statistics, applied mathematics or any other related domain, followed by at least 3 years of professional experience in bioinformatics and/or biostatistics in research or support to research activity,
  • or hold a PhD in bioinformatics, biostatistics, applied mathematics or any other related domain, followed by at least 2 years of professional experience in bioinformatics and/or biostatistics in research or support to research activity.
  • Strong experience in teaching bioinformatics/biostatistics will be a plus.

 

TO APPLY

Applications (cover letter, detailed CV and referees addresses) have to be filled on line at the following URL.

The deadline for applications is September 5th, 2017. Candidate pre-selection will take place around October 2nd, 2017. Short-listed candidates will be called for an interview between October 10th and 12th, 2017 (dates to be reserved absolutely).